结石部位不同，表现出来的疼痛症状也不相同。肾结石疼痛主要在腰部，可能伴腹部疼痛或恶心、呕吐等伴随症状。输尿管结石疼痛表现为剧烈的腹痛，如输尿管上段的结石，可能伴上腹疼痛。输尿管下段的结石伴下腹疼痛。
肾结石引起的腰痛可以是剧烈疼痛，也可以是胀痛或者酸胀痛。那么在什么情况下可以引起剧烈的疼痛？比较小的肾结石，通过掉入到肾盂或者输尿管内引起血管痉挛，肾盂内压力增高从而引起剧烈的腰痛。如果说梗阻程度比较重，引起了肾脏的中度或者重度积水，疼痛反而没有那么剧烈，往往是出现了胀痛或者酸胀痛这种感觉。
肾结石碎石没有明显的疼痛。体外冲击波碎石的原理是利用机器产生的冲击波能量通过传导到结石上，引起结石粉碎，但是可以感受到明显的震感。碎石后小的结石碎块，在经过输尿管排出的过程中，却可以出现剧烈的疼痛。
手术的过程中，通常会有麻醉，没有疼痛的感觉。激光在打石头的过程中，仅仅作用于石头，对人体的软组织不会造成损伤，是不会造成疼痛的。碎石术后，可能由于切口愈合会有轻微的疼痛，一般可以忍受。
在急性发作期的肾长结石就会出现肾脏绞痛，或者出现小腹部疼痛，临床上即使不排出体外，一般会持续24小时到48小时左右，但是肾结石在排出体外的时候，适当应用一些止痛药物或者消炎药疼痛就可缓解，平时要注意休息，不要多走动。
