肝功能检查中谷丙转氨酶和谷草转氨酶反应肝实质细胞的损害。其中谷丙转氨酶是最常用的敏感指标，血清谷丙转氨酶升高一倍，表明有1％的肝细胞发生坏死。谷草转氨酶数值高于谷丙转氨酶提示肝实质细胞损害严重。碱性磷酸酶和谷氨酰转肽酶反应肝内胆管细胞的损害和胆汁淤积，升高见于自身免疫性肝病、胆道疾病等。血清白蛋白降低提示肝脏合成功能受损。白球比例降低或者倒置提示病情比较严重。胆红素升高提示肝细胞受损。
乙肝表面抗原阳性，是存在乙肝病毒感染。乙肝表面抗体阳性，是曾经接种过乙肝疫苗并产生了抗体，或者曾经感染过乙肝病毒，具有一定的免疫力。乙肝表面抗原、乙肝e抗原、乙肝核心抗体阳性，这是乙肝大三阳。乙肝表面抗原、乙肝e抗体以及、乙肝核心抗体阳性乙肝小三阳。是目前处于急慢性乙肝感染期，具有传染性。
肝功能检查指标一般包括谷丙转氨酶、谷草转氨酶、总蛋白、白蛋白、球蛋白、白蛋白/球蛋白以及总胆红素。谷丙转氨酶偏高的原因有许多，如：急性肝炎、服用药物（尤其是对肝脏有损害的药物）、长期饮酒或一次饮用较大剂量时，以及某些胆道疾病、心脏病时的心力衰竭，发热等。
肝功能是比较常用的临床检测项目，肝功能正常，只能说明肝脏没有炎症损伤，但是不代表没有肝炎，有一些病毒性肝炎，如乙肝丙肝的，可能处于肝功能指标正常，所以要对其他的指标进行一些检查，才可以明确具体的情况。
肝功能有两层意思，一是指肝脏的生理功能，即解毒功能、代谢功能、分泌胆汁、免疫防御功能等。另一方面是指医院检验科里的医学检验项目，包括胆红素、白蛋白、球蛋白、转氨酶、r-谷氨酰转肽酶等等。反映肝功能的指标：总蛋白（TP）、白蛋白（ALB）、前白蛋白（PA）、胆碱酯酶（CHE）、凝血酶原时间（PT）。
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