一般来说，儿童睡眠障碍有如下病因：
一、儿童睡眠障碍的病因可能是儿童呼吸睡眠暂停综合症。
二、儿童睡眠障碍的病因可能是遗传，主要基因异常造成的。
三、儿童睡眠障碍的病因可能是环境，比如入睡相关障碍。
四、儿童睡眠障碍的病因可能是环境遗传与环境作用的结果。
导致儿童睡眠障碍的原因比较，可能与睡眠习惯不良，精神因素、社会心理等因素有关。
器质性病变，是由于脏器组织确实存在结构与功能的变化所引起的，经过治疗后，症状可缓解，但是脏器组织的病变仍然存在，不会完全恢复正常。功能性病变多是由于神经和体液调节所引起的病变，脏器本身不存在结构、功能的变化，经治疗后可完全恢复正常。
目前认为主要的“睡眠调节中枢”位於下丘脑腹前区，即视交叉上核，该区病变除导致睡眠-觉醒周期紊乱外，还可导致体温及进食活动的改变。医学上对睡眠的探讨，始於寻找“睡眠中枢”，位於下丘脑或第三脑室侧壁的病变能够产生持久的昏睡，但非生理性睡眠，亦不能解释醒-睡周期。
一般情况下，脑器质性精神障碍是否能恢复，需要根据实际情况来判断。
大部分由脑梗死、脑出血、脑外伤等原因造成脑器质性精神障碍，这种脑器官损伤是不可逆的，一般会持续很久，一般都是通过口服抗精神病药来进行治疗，通常不能恢复。脑炎、多发性硬化、病毒性脑炎、脑炎等都是可以治愈的，通过对原发性脑病进行积极的处理，可以使其恢复到原来的水平，这种情况下通常能够恢复。
偏头痛初期可以服用药物来缓解疼痛，日常生活中要注意减轻压力，保持愉悦的心情好个和足够的睡眠时间。如果想要治好，需要用显微血管减压术。这种手术是一种微创手术，可达到治疗偏头痛的目的。
可以口服调节神经的药物来治疗，器质性精神障碍，首先要积极治疗导致精神症状的器质性病因，在进行相应的病因疗法后，症状就可得到缓解。也要对症治疗症状。因为精神症状的存在，会影响躯体疾病的治疗。
