卵巢囊肿的治疗时间要根据病情的严重性来定，长期的饮食结构，生活习惯不好等因素造成体质过度酸化，引起代谢循环变慢，造成卵巢疾病和内分泌失调，免疫功能下降，从而发展为卵巢组织异常增生，终致卵巢囊肿。卵巢囊肿一般内科保守治疗是没有什么效果的，一般建议手术治疗。
如果是卵巢位置的囊肿和盆腔积液，就是注意这种细菌感染炎症并发的可能性非常的高，如果量少，可以先观察，看其能否自行吸收。如果量多，则一方面需要积极治疗囊肿，另一方面需要给予药物治疗盆腔积液。
如果卵巢囊肿很小，盆腔积液很少，可以不用手术。盆腔积液较多，伴有腹胀、腹痛、发烧等症状，应考虑是盆腔炎，可以口服头孢呋辛、甲硝唑、左氧氟沙星等，用药7-14天即可。卵巢囊肿不会引起盆腔积液，需要进行妇科检查，以排除恶性肿瘤引起的盆腔积液，如果有必要，可以进行外科手术或化学疗法。在生活当中也应当注意，不要过度的情绪激动，不要吃热性的食物，多吃蔬菜水果。
患有卵巢囊肿疾病可以用中药进行治疗，但是很难使囊肿消失，通常需要手术的办法，因为卵巢囊肿是增生性疾病，如果局部组织已经增生，仅凭使用中药治疗很难完全治愈，可以选择软坚散结、活血化瘀等中药进行治疗。
如果连续治疗两个月左右，病情没有恢复，卵巢囊肿没有减小，需要在医生的指导下考虑采取手术的方法，才能使卵巢囊肿消除。
如果是比较小的卵巢囊肿，患者吃中药有一定的效果，某些中药有抑制卵巢囊肿生长的作用，可以使卵巢囊肿缩小，可能会治愈，具体的用药方案或中药药方，建议咨询中医医师来确定。但对于超过五厘米或者恶性的卵巢囊肿患者，属于较大、较严重的情况，服用中药通常是没有效果的，部分西药的治疗一般效果也不明显，而需要及时进行手术治疗。
卵巢囊肿的后遗症症状有腹痛、月经不调、不规则出血、小腹疼痛等。中医中药长期临床实践积累了很多非常独特的治疗方法，可以采用可以快速清除湿热邪气，消散郁结，补气养血的传统中药配合治疗。
