肝门胆管癌恶性程度较高，但如果早期得到及时的手术及后续的综合治疗，存活在5年以上可能性较大。但很多肝门胆管癌发现时病程偏晚伴有远处转移，或病人肝功能不能耐受手术，只能行介入治疗减轻症状，一般寿命明显缩短，平均在半年。肝门胆管癌发现为晚期病人，不能接受任何治疗或放弃一些综合治疗，寿命一般只能维持2个月。
肝门胆管癌，该情况则是无法采取手术治疗。对于病人则是需要采取介入栓塞治疗，其次则是需要采取中药辅助抗肿瘤治疗，尽可能地延长时间及提高生活质量。保持心理愉快，多散步，呼吸新鲜空气，吃清淡食品。
肝门部胆管癌的首选治疗方式是手术切除，血管骨骼化、联合肝叶切除、扩大淋巴结清扫和胆道重建是肝门部胆管癌根治术的主要方面。必要时联合各类肝叶和血管切除技术，可以提高切除成功率。
生存期比较短，在3-5年，一般恶性程度比较高，可以考虑吃中药抗癌治疗比较好，可能难以介入治疗，可以中药抗肿瘤，增强患者抵抗力，有助于延长生存期，注意平时少吃多餐，加强营养，吃点鸡蛋，牛奶，有助于提高患者生活质量。
肝门胆管癌早期能治疗好，但是概率很小，肝门部胆管癌是指原发于胆囊管开口与左、右二级肝管起始部之间的胆管癌，是上皮源性恶性肿瘤.可以出现在肝门区的肝外部分，也可以在肝内部分。
肝门部胆管癌是胆道系统常见的恶性肿瘤，目前治疗肝门部胆管癌的方法繁多，有手术切除、化疗、放疗、免疫治疗、生物治疗、介入治疗等，但最有效的方法仍为手术切除治疗。对于无法手术的患者，进行引流或介入方法以延长生命，提高生存质量。