女性支原体、衣原体可以通过药物进行治疗。
妇科支原体、衣原体感染一般都是用一定量的抗生素进行治疗，一般情况下可以将其分离出来，然后进行药物敏感性测试，以确定哪些抗生素比较敏感，然后进行相应的治疗。常用的抗生素有红霉素、阿奇霉素等。对于支原体、衣原体等，一般不能使用其他的广谱抗生素。
如果是在正常的夫妻关系中，也会受到衣原体支原体的影响。衣原体可以由下列方式传染。
可以通过直接传播、性传播，衣物、被褥、毛巾、浴缸、卫生间等直接接触传染。
还可能会由孕妇和孕妇的产道传染给婴儿。在胎膜完好的情况下，衣原体支原体的传染不一定通过性接触，但是通过性接触是最常见的。
支原体是一种比较顽固的病原体，主要是通过性行为感染，容易产生耐药，如果不及时治疗或治疗不规范，会引起阴道炎、宫颈炎、盆腔炎、尿道炎等妇科炎症，建议多喝水，并在医生的指导下使用药敏试验中敏感的抗生素进行治疗。
多数无明显症状，少数重症者会有阴道坠感，当感染扩及尿道时，尿频、尿急是主要症状。感染局限在子宫颈，表现为白带增多、混浊、子宫颈水肿、充血或表面糜烂。感染扩及尿道表现为尿道口潮红、充血，挤压尿道可有少量分泌物外溢。
支原体、衣原体等是轻度或中度的，自身的免疫功能是可以自行恢复的。支原体、衣原体感染、自身免疫力低下等情况，是很难治愈的。
对于支原体、衣原体的治疗，可以选择红霉素、阿奇霉素、罗红霉素等三种药物。近年来，对支原体的抗药性越来越强。抗药性高达75%，使用红霉素类的药物也不一定有效。如果治疗无效，可以选择环丙沙星、左氧氟沙星等喹诺酮类药物。另外，四环素、多西环素、米诺环素等都是四环素。
支原体衣原体感染的严重程度，取决于它所引起的何种结果。
第一，造成不适，如支原体，衣原体尿道感染等，会引起尿痛或者尿道刺痛。支原体衣原体感染前列腺，就是前列腺炎，会导致尿频，尿急等不舒服。支原体衣原体感染精囊或生殖系统，会造成受孕困难。
因此支原体衣原体的感染严没有严重，需要对病症进行鉴别。
