许多肾囊肿性疾病与遗传和先天因素有关，如多囊肾、髓质海绵肾、肾多房性囊肿等，统称为先天性肾囊肿。由于单纯性肾囊肿多无症状，对肾功能和周围组织影响不大，因此不需治疗，只要六个月到一年随诊。如果囊肿直径较大，超过五厘米或产生周围组织压迫症状，引起尿路梗阻，则需要行囊液抽吸术并囊内注射硬化剂。如果囊肿巨大，直径超过十厘米则可能需要手术治疗。
如果是单发的囊肿，是单纯性的囊肿，是个良性的病变，肾囊肿没有临床症状时不做什么治疗，放松心情，注意休息，饮食勿食辛辣刺激的食物，定期检查，平时生活中在饮食上也要多注意，不要食用过多的辛辣的刺激性食物。
生理性的卵巢囊肿，不管是右侧还是左侧肿，通常都是不用进行特殊处理，这种卵巢囊肿一般体积比较小，会在月经来潮之后自行消退，建议患者随访观察即可，可以在月经来潮之后再做个B超检查，观察卵巢囊肿是否已经消失。如果右卵巢囊肿过大，超过5厘米，建议及时进行手术治疗，根据囊肿不同的情况可选择行囊肿剔除术或卵巢切除术。
肾囊肿是良性的病情，是不需要医治，但需要定期复查肾脏彩超，才能评估肾囊肿大小及有没有造成肾脏病情可能，如果定期复查肾囊肿增大，影响肾功能及腰部疼痛，就需要考虑手术医治。
肾囊肿分单发的，多发的，以及先天性多囊肾。单发的单纯性肾囊肿，往往都没有症状，往往都是因为体检发现的。这样的肾囊肿，如果小于五公分，不需要治疗，只需要定期的随访。每半年或者一年复查1次彩超，如果大于五公分，肾脏有压迫改变，那么可能就需要手术治疗。
乳腺囊肿是一种常见的女性疾病，多数为乳腺内低密度病灶，边界清晰，无明显压痛，治疗时，患者可以采用以下方法进行治疗：
第一点是口服中药，可以口服中药天冬素片、消核片、乳康片等，中成药的成分有利于吸收，减轻疼痛，减少囊肿体积。
第二点：如果囊肿体积的较大，有压迫症状，局部疼痛性包块可局部麻醉。
第三点：囊肿体积小于1厘米时，可采用真空辅助旋切术。
