目前对于临床已经确诊为间质瘤，如果没有手术禁忌，应当考虑进行手术治疗。虽然胃间质瘤生长较为缓慢，但是有潜在恶变的倾向，无论直径大小均应当考虑及时处理。目前对于胃间质瘤，可以腹腔镜下手术治疗。对于胃体和胃底的胃间质瘤应当考虑行胃楔形切除术。切除的范围应当距肿瘤1-2cm，不仅要完整切除肿瘤，还应切除部分正常的胃壁组织。
胃间质瘤这种疾病一定要及时的进行治疗，在早期的时候治好还是非常高的。胃间质瘤能治好的，胃肠道间质瘤，无特异性临床表现，病程可短至数天长至20年，恶性胃肠道间质瘤病程较短，多在数月以内。良性或早期者无症状。
胃间质瘤不属于癌症，而属于肉瘤，并且具有潜在恶性。胃间质瘤的恶性程度，需要依据肿瘤的大小和病理组织进行判定。胃间质瘤的恶性程度可以决定其治疗方式，主要以手术和术后辅助治疗为主。
胃间质瘤是发生于胃，起源于间叶组织，是属于非上皮组织而且恶性程度比较低的肿瘤。但胃间质瘤不同于常见的胃癌，胃癌是起源于胃的黏膜层，起源于胃的叫间叶组织肿瘤，跟胃癌来比是胃上常见的肿瘤，若发展成恶性肿瘤就是胃癌。间质瘤跟胃癌相比是起源不一样，还有是间质瘤少见发生率比较罕见，是少见的胃的恶性肿瘤。间质瘤是交界性肿瘤，可分为低度恶性和高度恶性。
不是癌症，属于恶性肿瘤。确诊为胃间质瘤，一定要到正规的医院去进行手术切除肿瘤，如果不及时进行手术治疗是很有癌变的可能。如果手术治疗的效果不是特别好，可以进行放疗治疗。
胃镜下胃间质瘤切除方法有ESD剥离术，隧道法和全层切除法是剥离术主要的方法，隧道法就是在胃黏膜下打隧道，找到病变挖除，然后把隧道口封闭，ESD挖除法指将黏膜表面剖开，把病变直接挖除。
