肾结石应该进行手术治疗。肾脏结石需要根据结石的位置、大小及是否造成肾脏积水等多因素决定如何治疗。最常用的治疗方法是体外冲击波碎石。肾脏结石在2厘米以下的首选治疗方法，体外冲击波碎石无任何创伤。经过体外冲击波碎石后，需要定期进行观察随访，直至结石完全击碎排出为止。如果经过体外冲击波碎石治疗后的肾脏结石，没有任何的排出和改变，则可以选择手术治疗。
肾结石有传统的保守治疗，有碎石治疗，还有手术治疗，需要根据结石的大小和结石的部位来确定，一般是五毫米以下可以使用保守药物治疗，还有结合运动。如果结石大于五毫米小于八毫米的，可以选择碎石。
肾结石在治疗时通常包括药物排石、体外碎石和手术排石等排石方法，临床可根据结石的大小来选择合适的排石方法，一般直径小于6毫米的结石多选择药物排石，如中药的排石冲剂和西药；6毫米到2公分之间的结石可以选择体外震波碎石，如结石过大可选择经皮肾镜和输尿管软镜碎石，或选择开放性手术进行排石。
长了肾结石，多数应该靠自己或者靠药物就能够排出来，80%以上都是自己排出去的，真正需要体外碎石，进行手术处理的只占20%左右。所以多数通过药物，通过多饮水、多活动就能排出来。比如做体检时发现肾脏有这种结石，比较小，没有引起肾积水，也没引起腰痛、血尿等一些症状，一般就可以不处理，进行观察。如果引起相应症状，引起积水，影响肾功能，还是应该处理。
肾结石的治疗根据结石的大小而定，如果说是比较小的结石，并且有血尿的症状，可以考虑体外碎石治疗，如果说比较大的可以考虑到医院的泌尿外科进行检查，查明情况，对症治疗。
