如果肾囊肿直径较大，超过5cm，或者是产生周围组织压迫的情况时，可以引起尿路梗阻的，需要行囊液抽吸术并行囊内注射硬化剂，这样可以避免囊肿的再次扩大。如果肾囊肿的直径>10cm，囊肿表现的比较巨大，对于肾脏组织压迫也影响比较大，需要手术治疗。
胎儿肾囊肿无需进行治疗。
因为胎儿肾囊肿的发病原因，与遗传因素或者先天发育异常有关。绝大多数的囊肿都属于良性病变，生长速度非常缓慢。单发的肾囊肿，对于胎儿的身体健康以及出生后的身体健康，都没有明显的不良影响，通常是不需要进行特殊治疗的。如果囊肿体积增大，可以进行手术治疗或穿刺抽液治疗。但如果对胎儿的身体较大时，应选择终止妊娠。
肾囊肿最好先检查囊肿的大小，如果是比较小的囊肿或者是没有对周围组织产生影响的囊肿不需要治疗。如果是比较大的囊肿，或者是已经对周围组织产生压迫，则需要通过注射硬化剂或者是通过手术来治疗。
可以通过服用利水渗湿祛湿的药物来治疗，如果肾囊肿比较小是可以起到一定的效果的。中医认为本病多是由于肾精不足、痰瘀阻滞、脉络不畅所致。平时饮食宜清淡，注意防寒保暖，避免过度劳累。
左侧肾囊肿如何治疗，根据其大小、位置决定处理方法。如果是肾实质的小囊肿，直径小于5厘米，对肾脏无影响，定期复查，动态观察即可。肾囊肿直径大于5厘米，可压迫肾脏，位置靠近肾皮质，并部分突出肾脏的，可以行肾囊肿去顶减压术。
