肝内胆管癌是不容易治疗好的。手术切除是肝内胆管癌的首选治疗方式。手术的范围要看患者的癌肿部位以及癌肿的大小，通常手术方式包括左右半肝切除术、肝叶的部分切除术，以及肝段部分切除术等。
在治疗上应该采取积极的手术治疗，把原发性肝癌的位置进行切除。如果手术不耐受，身体条件比较差，心肺功能又比较差，可以配合中药的巩固治疗。中医对肝内胆管切除以及不能耐受切除的病人都是有很好的作用，可以杀灭血液中残留的肿瘤细胞，还可以通过介入导管的灌注化疗。
一旦发现肝内胆管癌，常处于中晚期，只有少数能达到根治性切除，部分患者做手术切除不彻底，只能达到姑息性切除，还有部分患者由于发现肝内胆管癌已在腹腔内播散，无进行根治性切除。所以肝内胆管癌切除率较低。肝脏手术属于高风险手术，容易出现出血、术后肝功能衰竭等严重并发症。一般手术死亡率可以控制在3%以下，术后并发症的发生率一般可以控制在30%以下，多数患者通过手术能够康复出院。
肝内毛细胆管炎治疗包括抗炎、保肝、解除胆道梗阻，利胆以及其他支持等治疗，主要有内科保守治疗和外科手术治疗。内科保守治疗当中，病人如果能够改善症状，促进病情缓解，可以避免手术。
胆管癌是指原发于左右肝管汇合部至胆总管下端的肝外胆管恶性肿瘤。原发性胆管癌较少见，由于血管、淋巴组织、神经束膜、肝组织等周围组织众多，使得胆管癌起病隐匿、较难以发现。
肝内胆管结石的治疗根据病情的轻重程度及治疗是不一样的。如果经过CT或磁共振评估，肝内胆管结石很少，或者根本没有引起胆道扩张，狭窄畸形，肝脏也无改变，也没有临床症状，那么这种结石可以不用特殊治疗，只需要平时注意避免劳累受凉，少吃油腻食物，必要时可以服用利胆药物即可。而对于有经常发作胆管炎或导致胆管狭窄畸形，或是引起肝脏萎缩，癌变等等情况等，需要进一步手术治疗。
