可以做，可以在月经干净一周内安排手术。巧克力囊肿如果较大，有较明显的痛经是需要考虑手术的，宫腔镜是微创，损伤较小，恢复快，这种病只要不彻底切除宫腔附件就会有复发的可能，术后应该是可以正常生活的。
卵巢囊肿手术一个月月经干净后要去医院复查，主要是做妇科B超检查，看看术后卵巢恢复情况，且卵巢囊肿有可能复发，今后每半年~一年也要复查妇科B超，看看子宫附件情况。
生育期的女性如果有卵巢巧克力囊肿，直径大于3个cm，就需要手术治疗。巧克力囊肿可以压迫正常卵巢组织，影响排卵。此外它可以影响盆腔的内环境，影响正常的受孕，囊肿直径大于3个cm，这种影响会加大。
巧克力囊肿是由于子宫内膜异位症导致的，是因为一位的子宫内膜随着月经周期发生周期性出血，但是血液无法正常排出，所以局部会出现肿大和疼痛，囊肿内的血液因为长期不能排出呈巧克力状。巧克力囊肿一般选择的是腹腔镜手术切除，属于微创手术，术后身体恢复较快，费用2千-3千元。
腹部手术后不同程度都有粘连，饮食清淡低盐易消化，避免难以消化的食物及刺激性食物饮料等，避免暴饮暴食。要加强营养，注意禁止辛辣的情况，配合多食新鲜的水果蔬菜较好，观察平时的月经情况是否正常，同时建议定期配合复查彩超情况较好的，注意休息。
巧克力囊肿腹腔镜手术最佳时间并没有明确要求，需要根据患者的情况来分析。
巧克力囊肿的手术时机并不是很确定，要根据患者的具体病情来决定。卵巢巧克力囊肿最好避开经期进行手术当然，女性在月经结束后3-7日是手术比较好的时间。女性月经来潮后3-7日需要进行输卵管和子宫的检查。如果伴有卵巢朱古氏囊肿，需要进行子宫内窥镜下的子宫不育和双侧输卵管畅通的检测。
