进行肛门检查，首先应当选择合适的体位，可选择膝胸位、截石位、弯腰俯卧位，有时也可以采取左侧卧位，选择合适的体位，对检查疾病有很大的帮助。首先应当进行肛门视诊，观察肛门的位置是否有异位变形等。然后观察肛门周围的皮肤及颜色，是否存在着红斑、糜烂、渗出，是否有肿物。
贫血需要做血常规，网织红细胞计数，白细胞详细分类，贫血四项，肝功能，肾功能，这些检查对确定由于什么原因造成的贫血有很大的帮助。结果出来后，需要依据病人不同症状，需要选择在相关的一些病因方面的检查。
肛瘘的检查方法可以做肛门指检，肛门指检为最常见、最直接的检查方法，可触及条索状物及硬结。还有就是美兰造影，将美兰从外口打进，如果美兰由肛门流出，可诊断肛瘘。影像学检查包括B超、磁共振、肛瘘造影。手术探查需在麻醉状态下进行。
出现血精的问题，主要是精囊等部位出血造成的，如果泌尿系统没问题，那么就应该对精囊进行检查。造成这样问题出现的原因主要还是炎症，所以应该采用抗生素的药物来进行治疗。平时还要注意卫生，避免手淫，饮食禁忌辛辣刺激，戒烟酒，禁欲等。
检查包皮过长可以观察阴茎，如果包皮口接近尿道外口，而且包皮能方便地上翻至冠状沟，则为包皮稍长，其次在正常疲软的状态下，如果包皮没有位于冠状沟内，那么就是包皮过长。
