复发性口腔溃疡的主要病因并不明确，但是科学文献证明，它与以下几种原因存在相关性：1、与患者的精神因素有关，如果患者的心态不好、工作压力大、心理负担重，很有可能会患上这一类的疾病。2、与患者的休息有关，如果患者的工作繁忙、睡眠不足，很有可能导致这类疾病的发生。
是复发性口腔溃疡。免疫因素，细胞免疫异常，自身免疫异常，体液免疫异常，也有可能是免疫功能低下或者是免疫缺陷。胃肠道疾病、遗传因素、微量元素铜、锌缺乏和维生素缺乏，微循环障碍，精神有创伤。
可能是由于体内虚火旺盛，自己的身体长时间处在一个上火的状态，比如长时间的熬夜，作息不规律，一直爱吃辛辣刺激的食物，久坐不运动等原因都可能使自己体内虚火旺盛，长口腔溃疡。还有一种可能是身体内缺乏微量元素，比如铁、锌、各种维生素等，身体免疫功能降低或者营养不良，增加口腔溃疡发病的可能性。
可能是局部创伤、精神紧张、食物、药物、激素水平改变及维生素或微量元素的缺乏所致成。系统性疾病、遗传、免疫及微生物在口腔溃疡的发生发展中可能也起着重要的作用，预示机体有潜在的胃肠疾病、血液病、内分泌等系统性疾病。
此病常见的诱发因素有：压力大、精神高度紧张、经常熬夜、便秘、胃肠消化不良等，另外女性月经前后和更年期体内激素会有变化，故当女性月经不调时候或者更年期也易多发本病。此外该病还与遗传、身体免疫力低下、内分泌失调、体内缺乏某种微量元素如锌等有关。
