早期的胚胎停止发育，多数是胚胎本身的问题，属于自然淘汰的过程。如果只发生1次胚胎停止发育，一般不作过多处理。对于2次或者2次以上的胚胎停止发育，需要寻找原因，比如夫妻双方染色体异常，导致胎儿染色体异常，母体封闭抗体缺失——母体中胎儿保护性抗体缺失，母体抗心磷脂抗体(+)，导致微小血栓形成后胚胎供血异常等。
胚胎停止发育的原因是比较多的，比如孕妇自身的因素、子宫发育畸形或者是免疫力低下、某些传染性疾病等。在怀孕期间用过药、或者是接触放射线，有可能是内分泌出现了异常情况。多数情况和染色体发育异常，有一定的关系。
胚胎停止发育很有可能是基因或者是染色体异常引起的，具体是哪方面的染色体异常造成的，在下次备孕之前一定要夫妻双方都去做个详细检查，多吸取这一次的经验，避免胚胎停止发育。
就是生殖内分泌方面，因为胚胎早期发育的时候，需要三个重要的激素水平，一个是雌激素，一个是孕激素，一个是绒毛膜促性腺激素，如果母体自身的内源性激素不够，就会造成胚胎的停育。生殖免疫的问题，如果自身有某种抗体，就会抵制胚胎的发育。
胚胎停育是指在孕十二周前胚胎在某些因素的影响下导致发育停止。大部分的胚胎停育是染色体问题导致的，男性精子活力差、畸形精子率高也可导致胚胎停育，子宫畸形也会引起胚胎发育不良。
胚胎停育的原因有生殖内分泌方面，因为胚胎早期的发育的时候需要三个重要的激素水平，雌激素、孕激素、绒毛膜促性腺激素，如果母体内源性激素不足就会造成胚胎的停育。二是生殖免疫问题，如果自身有某种抗体就会导致胚胎的发育。三是子宫的问题，如果子宫的内环境不好或者是畸形也不会发育。第四是染色体问题。
