一般来说，阴茎上长肉芽可以使用激光或者冷冻的方式切除。
阴茎有肉芽可能是炎症刺激，赘生物或是湿疣的情况，这是一种性传播疾病，确定是尖锐湿疣引起的，建议可以选择用激光或者冷冻的方法，去除局部的疣体。建议患者这段时间要禁止性生活，建议营养均衡，不要吃辛辣刺激食物，局部清洁卫生，属于良性病变，注意观察即可。
阴茎肉芽复发的症状，开始为细小的淡红色丘疹，以后逐渐增大，数目增多，表面隆起，多数质地脆而硬，高低不平的疣状增生，临床上依其形态分为蕈状、鸡冠状、菜花状、乳头状。随着时间的延长，病人传染性降低，复发的可能性亦降低。病人经治疗后6个月不复发，就算临床治好了。
阴茎上长个小肉芽，首先要高度怀疑是尖锐湿疣引起的。
尖锐湿疣分布在阴茎的包皮、龟头、尿道口，甚至阴囊、肛门周围等，表现为乳头样或者菜花样的突起，表面可有分泌物，表面不光滑，触碰时可有轻度的疼痛感，并且触碰时可能存在有出血。如果患者发现自身存在此现象，需要及时前往医院就诊，治疗上用抗病毒的药物治疗，还需使用免疫抑制剂，阴茎上的小肉芽则需要通过手术去除。
阴茎上长肉芽是尖锐湿疣，具体分析如下：
由于患者一个月内有不洁的性接触史，感染了人乳头瘤状病毒引起的尖锐湿疣引发阴茎上长肉芽。建议患者出现相应症状后及时到医院进行检查，明确病因后进行针对治疗。如果是尖锐湿疣，可以使用干扰素软膏来治疗，以免复发。
建议患者在日常生活中注重私处卫生的护理工作，保证皮肤清洁卫生，穿全棉内裤，治疗期间不要有性生活，避免发生细菌感染。
尖锐湿疣初期症状是阴部会出现少数微小谈红色丘疹，男性多见于包皮、龟头、系带及尿道口，尤其以阴唇、明道、阴蒂、肛周及宫颈为多见。在初起时为散在性的小而细嫩、顶部呈尖形的淡赤色疣状丘疹，以后日趋增大增多。
不良性行为。据不完全统计，与多个性伙伴发生关系者患有尖锐湿疣的几率要比单一性伙伴患者要高的多。在一定的范围内，性生活的年龄也是尖锐湿疣的危险因素，首次年龄小于19岁者，其发病率及复发率均显著增加。