垂体囊肿可以通过手术去除，可以开颅手术采用额下外侧入路，另外一个是经鼻蝶手术，也就是通过鼻内镜手术。前者的手术创伤大，后者的创伤小一些。当然，囊肿是良性的病变，如果现在囊肿很小，没有影响垂体功能，是没有必要做手术的，这不会有什么特别的影响。只有囊肿非常巨大，对于垂体和视神经造成压迫出现明显症状的，才有必要做手术处理。
如果囊肿非常小，没有引起临床症状，尤其是没有垂体激素水平下降的症状，一般不需要进行治疗，但一定要注意密切随访，定期复查。主要是根据囊肿的大小和临床症状，进行针对性治疗。
通常来说，垂体性甲减需要治疗，具体分析如下：
建议患者口服甲状腺素片以维持血液中的浓度，修复甲状腺的正常功能。一部分垂体性甲减患者需终身吃药，一部分患者可在清除发病原因后断药。服用左甲状腺激素时患者需要定期复查甲状腺功能，随时随地调节服药剂量，同时注意进高维生素、高营养饮食，避免吃油腻辛辣刺激性的食材。
垂体腺瘤一般需要治疗。
垂体腺瘤是一种由垂体内的腺体所引起的一种肿瘤。垂体瘤99%都是由垂体腺瘤引起的，除了垂体腺的肿瘤之外，还有垂体下的脑部也有可能出现这种情况。垂体瘤可以通过药物治疗、放射治疗和外科治疗来治疗，一般都是通过鼻外科进行微创手术，大多数情况下都能完全去除，相对来说比较保险，但是术后要注重鼻腔的防护和日常的膳食。
脑垂体萎缩可以通过药物进行治疗。
脑垂体萎缩是一种引起垂体的功能下降的疾病，这种疾病会影响到垂体相应的激素水平，在治疗的时候，要先消除病因，然后再进行靶腺激素的长期替代治疗。比如垂体功能低下的第一步是补充肾上腺皮质激素，其次是肾上腺皮质激素，然后是甲状腺激素，可以从低剂量逐渐增加，如果是年轻的，可以进行性激素的补充。
