要注意劳逸结合，不要过度劳累，避免高度紧张及精神刺激，保持乐观开朗的心情，和平和的心态，增强机体的免疫力，平时注意保暖避免感冒受寒。加强体育锻炼，增强体质，多在阳光下运动，多出汗可将体内酸性物质。有辅助恢复的作用。
服用消炎、止痛、化瘀的药物以及注意个人卫生，饮食尽量以清淡为主，对于辛辣等刺激性食物要忌口，保持心情的愉快，定期到医院复查体检，预防囊肿复发。手术后有分泌物增多、分泌物黄色、出血的现象，不需要过于担心，这些都是属于正常的现象。
巧克力囊肿术后饮食上需要注意多吃富含蛋白质、维生素的食物。月经期间的女性一定要杜绝性生活，要注意自身的保暖，避免感冒、受凉。月经期间要禁止一切的激烈的体育运动以及重体力劳动，还有要学会控制自己的情绪，不要生闷气，否则容易导致内分泌的失调。
饮食要的注意忌食羊肉、虾、蟹、鳗鱼、咸鱼、黑鱼等发物以及像酒类、辣椒、酸菜等的酸、冷、辣的食品，在经期更要注意一些。饮食要注意多吃些玉米等的五谷杂粮，提倡多样化饮食，平时可以多吃些芝麻、花生、瓜子等，维持营养所需。应该坚持低脂肪饮食，多吃瘦肉、鸡蛋、绿色蔬菜、海带、香菇以及新鲜水果等。
巧克力囊肿经期要注意保暖，避免发烧感冒。严禁在经期做剧烈运动和过重体力活，包括禁止性生活。月经期间要注意调节情绪，保持乐观开朗的心态，使机体免疫系统的功能正常，生气会导致内分泌失调。在女孩青春期尽量避免过度惊吓，否则容易导致闭经。
伴随有巧克力囊肿，同时怀孕的情况下，怀孕对这种巧克力囊肿有抑制卵巢囊肿增大的趋势的可能性。所以如果想要继续保留这种胚胎，在怀孕期间记住要定期复查B超，来了解卵巢巧克力囊肿的情况。
