患有肾结石肾囊肿是严重的，是需要进行手术治疗的，如果症状不明显，可以定期复查，观察变化。一旦生长迅速或者临床症状严重，就及时手术。平时要注意避免过度劳累和剧烈运动。注意保暖和休息。养成多喝温水的习惯。
可喝柠檬水，柠檬水因其含大量的柠檬酸钠可以防止结石。也可使用金钱草沏茶或用水煮的方法来服用，可以起到预防结石的作用。另外玉米须也有利尿消食的作用，用水煮后饮用可预防结石的发生。
肾脏结石都考虑为饮食结构不均衡，饮水较少和个人先天体质都有一定的原因存在。首先要避免含钙质的食物过多摄入，比如菠菜和豆制品要注意多饮水，多排尿，对泌尿系统起到一个冲洗作用，也有利于防止结石的发生。
选取肾俞、膀胱俞、命门、中极、三阴交、阳陵泉进行艾条灸。石淋不得小便者，可加灸关元、气门、大敦等穴位。选取膀胱俞、阴陵泉、三焦俞、行间、太溪进行艾炷灸。发热者可加灸合谷、外关，血淋者可加灸血海、三阴交。选取膀胱俞、肾俞、志室、水道、三阴交、三焦俞、太冲、归来、气海、足三里等穴进行艾炷灸。选取气海、脾俞、膀胱俞、阴陵泉进行温和灸。选取肾俞、命门、神阙、关元进行艾炷灸，神阙采用隔盐灸，余穴直接灸。
结石形成后，对于一般小的固定性结石，一般不会造成感染，可以很多年都不会改变，也不会影响肾功能，但是有时肾结石滑落到输尿管里造成突然梗阻不能及时解除时，由于结石一般都是有不规则的棱角的，嵌顿在输尿管以后会对输尿管的内壁形成创伤，从而引起血尿。