胎儿肾囊肿无需进行治疗。
因为胎儿肾囊肿的发病原因，与遗传因素或者先天发育异常有关。绝大多数的囊肿都属于良性病变，生长速度非常缓慢。单发的肾囊肿，对于胎儿的身体健康以及出生后的身体健康，都没有明显的不良影响，通常是不需要进行特殊治疗的。如果囊肿体积增大，可以进行手术治疗或穿刺抽液治疗。但如果对胎儿的身体较大时，应选择终止妊娠。
左侧肾囊肿治疗，根据其大小、位置决定处理方法。如果是肾实质的小囊肿，直径小于5厘米，对肾脏无影响，定期复查，动态观察即可。肾囊肿直径大于5厘米，可压迫肾脏，位置靠近肾皮质，并部分突出肾脏的，可以行肾囊肿去顶减压术。
囊肿的治疗是腹腔镜肾囊肿去顶减压手术，或者是开放性的囊肿去顶减压，也可以通过经皮囊肿穿刺抽液，然后注射无水酒精破坏囊肿的壁，囊肿的分泌功能受损，不会再增大。
双肾囊肿没有症状不需要治疗，如果说囊肿超过一定长度，比如五厘米，这样的话应该进行的相应的治疗的，垃圾食物少吃，多吃绿叶蔬菜为主，可以配合中药汤剂调理一段时间。可以减少该病产生的疼痛。
可以通过服用利水渗湿祛湿的药物来治疗，如果肾囊肿比较小是可以起到一定的效果的。中医认为本病多是由于肾精不足、痰瘀阻滞、脉络不畅所致。平时饮食宜清淡，注意防寒保暖，避免过度劳累。
