肾囊肿的药物治疗，目前来说没有什么特效药针对肾囊肿让囊肿不长或者是消失。主要还是因为肾囊肿它主要是肾小管憩室形成的，跟年龄相关，可能是属于退行性的改变。而且肾囊肿它对身体没有什么太大的影响，即使是肾脏中有几个，两个、三个，甚至是五个、十个的小囊肿，它对肾功能以及生活都不会造成任何影响。
肾囊肿早期一般无症状，但囊肿会不断增大而出现腰，腹部不适或疼痛；后期会因本身囊内液压力增高而破裂出现血尿，或腹部可触及肿块等情况.一般采用穿刺硬化方法治疗，但也容易复发.。此病药物效果不佳，建议不要用药物治疗。
目前西药还没有治疗肾囊肿的特效方法。对于小的肾囊肿，无症状时不需要做任何治疗，但要定期复查，观察囊肿是否继续增大，如果增大到一定程度可以在医院进行囊液抽吸术，并在囊内注射硬化剂治疗。
有可能是肾部位局部组织细胞异常增生反应引起的肾囊肿，需要依照具体的症状使用软坚散结的药物进行治疗，从而控制肾部位的囊肿，如果症状进一步加重，肾囊肿进一步增大，是需要及时进行手术切除囊肿的。平时需要注意观察具体的反应调节。
肾囊肿是可以运动的，但是如果囊肿比较大，要避免剧烈运动。肾囊肿是肾脏的一种良性病变，好像皮肤上长了一个痣。在很小的时候，对于运动没有什么要求，不管是缓和的运动，还是剧烈的运动。如果囊肿比较大，这要选择那种比较缓和的运动，避免剧烈运动，尤其怕在剧烈运动过程中导致碰撞、挤压，有可能导致囊肿破裂而出血。
