子宫内膜异位卵巢巧克力囊肿可以怀孕，但是怀孕的几率比较低。如果巧克力囊肿的周围没有粘连，输卵管通畅，卵巢有排卵，就能够怀孕。如果巧克力囊肿形成的时间较长，囊肿内反复出血，输卵管卵巢周围粘连严重，输卵管伞端粘连包裹，输卵管不通畅，就不能够怀孕。
子宫内膜异位症是一种常见的妇科疾病，对身体健康又严重的影响，而且还有可能导致女性的不孕，因此及时的发现和治疗子宫内膜异位症是非常重要的。目前，对子宫内膜异位症的检查通常采用以下三种方法：B超检查、X线检查和腹腔镜检查。
子宫内膜异位症巧克力囊肿是可以吃豆制品的，在日常生活当中一定要注意避免使用果酸的食物，主要是因为酸性的食物本身就会起到固涩收敛的作用，这样很不利于血的畅行和排出，比如芒果、酸枣、荔枝，都要减少食用。
这两个是属于不同的疾病，子宫内膜异位症是由于子宫内膜移位于正常的宫腔向宫腔以外的组织生长，巧克力囊肿一般是由于体内的激素水平升高，形成的淤血块，发现之后立即通过手术进行切除之后再做个病理，子宫内膜异位症会导致进行性痛经，也可以通过手术进行治疗，或者是使用一些激素类的药物进行治疗。
卵巢子宫内膜移位囊肿，可以结合临床症状对症治疗，可以在医生指导下配合活血化瘀药物治疗，可以去医院中医科进行辩证治疗。平时要注意个人卫生，养成良好的生活习惯，饮食行为很不要吃油腻食物和油炸食物，控制体重在正常范围，不要吃非季节性蔬菜水果，不要吃含有激素的食物。
巧克力囊肿院行腹腔镜手术，现医院检查发现复发，卵巢巧克力囊肿特点就是容易复发，特别是对于年轻女性。饮食上没有特别需要注意的，少吃点豆制品，如果巧囊不大，可以不用治疗，如果巧囊大了，可以再次考虑手术剥除。
