多数先天性肾积水经过适当的治疗，是存在治愈的情况的。
先天性肾积水属于先天性发育不正常，需要积极配合手术治疗，是有机会治疗痊愈的。肾积水是由于泌尿系统阻塞导致肾盂和肾盏扩张，尿液潴留。由于肾内尿液积聚，压力升高，肾盂及肾盏扩大，肾实质萎缩。肾盂输尿管交界处梗阻是肾积水的主要原因。建议日常家长多以清淡饮食为主，通过母乳喂养的婴儿可以有效帮助病情的恢复，避免食用过于刺激的食物。
治疗主要得根据输尿管狭窄段的长短，以及狭窄的病因来治疗。如果输尿管的狭窄段很短，不超过2cm，比如肾盂输尿管连接部先天性狭窄，或者输尿管的膀胱入口处，因为各种原因导致的狭窄，狭窄段如果不超过2cm，可以进行腹腔镜下微创手术。
先天性肾积水不能自愈。一侧肾积水，另一侧肾功能会明显变强，能满足机体需要，如果双侧先天性肾积水，血肌酐明显升高，要进行输尿管的支架术或者输尿管的手术，改善输尿管狭窄，防止肾功能受损。
先天性的肾积水，如果没有明显的实质性的影响性，可以进行定期观察的治疗方式，到专业的儿童泌尿外科来检查肾脏的B超和肾脏功能以及血尿常规来做出一个动态的观察，如果有明显的增大或肾脏功能有异常，要考虑手术的方式。
已经诊断为先天性轻度肾积水。由于是先天性的因素，所以考虑先天性的输尿管狭窄的可能性较大。可以进一步行尿路造影检查，明确诊断。也可以通过外科手术的方法进行治疗，切除狭窄的输尿管段。