扁平疣治疗上可以用物理疗法或药物疗法、中医中药疗法等。物理治疗主要选用液氮冷冻和激光治疗、疣组织包埋疗法。中医中药疗法有耳后放血法、火针法、穴位注射法等。药物治疗可以服用增强免疫的药物，因为扁平疣多发生于免疫力低下人群，免疫力增强后，有自身清除病毒的可能，扁平疣是有自愈性的。
扁平疣是由病毒感染引起的疾病，容易发生在面部，由于扁平疣具有一定的传染性，尽量不要抓伤和刺激，可以先外用软膏局部试试，如果没有好转可以去医院进行检查，根据医生指导用药。
扁平疣去除一般可以进行皮损内注射或系统药物治疗等。
1、皮损内注射：平阳霉素用1%普鲁卡因稀释于疣体根部注射。维生素D3皮损内注射，对于多发性扁平疣具有一定的疗效。
2、系统药物治疗：在经过医生诊断后，在医生指导下可使用免疫调节剂，如干扰素等。
扁平疣是一种人乳头状瘤细菌。因此，如果患有扁平疣，要吃一些能清热解毒的食物。不要吃辛辣刺激的食物。对于已经形成的扁平疣，可以通过激光手术治疗。治疗后，必须注意皮肤护理。不要碰水。不要刺激皮肤，一般1-2周后会缓解。也要保证充足的睡眠，不熬夜，适当运动，提高身体免疫力。避免过度劳累。
扁平疣是由于人类乳头瘤病毒感染而导致的一种皮肤的疣状增生物，在面部涂上光敏药物，再通过光照射医治，效果也不错。还有如果数目真的很多，可以考虑服用药物，对于医治效果也非常好。
