肾囊肿如果较大，比较明显的压迫肾实质导致肾实质变薄，或者可能与肾盂接触导致肾盂、肾盏受压，可能会引起尿蛋白，也就是蛋白尿，但患者还需要去肾内科积极就诊，以排除其它疾病导致的蛋白尿，如肾病综合征或者肾炎综合征也会引起尿蛋白，但患者应该明确是否存在血尿、蛋白尿、高血压、水肿或者高脂血症。
肾囊肿是否会引起腰疼，要看囊肿的部位、大小和数量。囊肿直径小于五厘米的情况不会有任何感觉和不适。若囊肿直径比较大，会产生疼痛，如是合并感染，会因为感染出现发热胀痛的情况。
右侧肾囊肿会引起腰疼。比较小的囊肿在检查时容易发现，极少数可能会因为囊肿破裂出现肉眼血尿、尿常规检查有潜血等表现，任何症状的，都可以不用做任何的处理，定期做彩超复查，随访观察即可。
肾囊肿有可能基因突变也是引起的发病，也有可能是先天遗传因素是肾囊肿最常见的，各种中毒对肾脏的损伤，例如常见的毒物有农药、化学制剂、放射线、污染等，有些感染的原因产生了有利于肾囊肿基因变化的因素，也可以引起肾囊肿。
囊肿一般都是先天性的，胎里带来的，从生出来就有的，但是后来囊肿可能逐渐增大，增大以后压迫到邻近的器官或者自己的器官负担过重。我们可以进入注射治疗，可以穿刺进去以后在囊肿里注射药物，让囊肿彻底萎缩坏死，就能达到一定的治疗目的或者干脆手术切除也可以。
肾结石和肾囊肿是两种不同的病，是否会引起血尿需要根据病情的严重程度来判断。
两者的发展和肾中央的位置不同，肾结石位于肾盂内，而肾囊肿则在肾本质内，不在排泄体系内。肾结石一般会导致血尿，也可能是肉眼血尿，其具体的程度取决于患者的身体状态，例如混合性的炎性血尿。囊肿通常不会出现血尿，如果囊肿与肾盂肾盏相连，那么就会出现血尿，不过大部分时候都不会出现血尿。而另一种是先天性多囊肾，其内部存在着许多的囊肿，破裂进入肾盂和肾盏时会出现血尿。
