进行肛门检查，首先应当选择合适的体位，可选择膝胸位、截石位、弯腰俯卧位，有时也可以采取左侧卧位，选择合适的体位，对检查疾病有很大的帮助。首先应当进行肛门视诊，观察肛门的位置是否有异位变形等。然后观察肛门周围的皮肤及颜色，是否存在着红斑、糜烂、渗出，是否有肿物。
肛窦炎的病人可以肛门指诊检查、肛门镜检查等检查的结果进行相应额打确诊。如果病人是症状轻微的是可以采取药物治疗、坐浴的方式进行保守治疗。在病情恶化时，病人可以采取切除术、切开术等手术治疗。
早期肛瘘通过直肠肛门指检，可以摸到条索状的一个管道、大部分通过目测和直肠肛门指诊即可检查出来，少部分复杂或难以确诊的，做腔内超声或者是肛周超声或核磁共振进行确诊，通过直肠腔内超声，能够发现直肠肛围的脓肿、管道等。
出现血精的问题，主要是精囊等部位出血造成的，如果泌尿系统没问题，那么就应该对精囊进行检查。造成这样问题出现的原因主要还是炎症，所以应该采用抗生素的药物来进行治疗。平时还要注意卫生，避免手淫，饮食禁忌辛辣刺激，戒烟酒，禁欲等。
狐臭如果说比较严重的情况下，自己都可以闻到，没有什么检查方法；如果比较轻微的，是可以不用治疗的，狐臭如果比较严重，可以用手术方法治疗，比较彻底，基本无复发。
