甲状腺功能减退的治疗方法是甲状腺激素替代治疗，但在开始治疗前，必须确定这种甲状腺功能减退是否是永久性疾病。亚急性甲状腺炎后甲状腺功能减退一般为短暂减退，无需立即开始治疗。
另外，对于药物性甲状腺功能下降，停药后甲状腺功能逆转，无需立即进行药物替代治疗。对于永久性甲状腺功能减退患者，治疗目标是将血清促甲状腺激素水平维持在正常参考值范围内。治疗药物选择左旋甲状腺素片，治疗起始剂量因人而异。
婴儿出现甲状腺功能低下的情况一般是由先天性甲状腺功能不全所引起的。
与此同时，如果女性在怀孕期间患有严重甲状腺激素不足的病症的话，也是会诱发所诞下的婴儿甲状腺功能低下症状的，当然也可能是由家族遗传性甲状腺功能低下引起。但是无论是哪个原因引起的，都需要立即对新生婴儿进行诊治。否则，将来甲状腺功能低下会影响婴儿的智力发育，也会影响婴儿骨骼的发育。
甲状腺功能低下对怀孕有明显的影响。因为甲状腺功能低下可能造成怀孕以后胎儿的甲状腺激素减少。甲状腺激素是维持机体正常生长发育不可缺少的激素，特别是对胎儿和新生儿脑的发育尤为重要。
甲状腺激素分泌减少或者体内代谢降低会导致甲状腺功能低下，要忌食生冷刺激性的食物，多吃维生素蛋白质高的食物，要做好保暖，养成每天排便的习惯，会影响其他器官的功能。
甲状腺功能低下由于原因和表现都不相同。有些患者是由于做了甲状腺手术而导致的甲减，有些患者是由于桥本氏症导致的，有些患者是由于服用了一些药物而导致的。如果出现怕冷、心动过缓、少言懒言、心情低落等症状，建议去正规的医疗机构进行检查，医生会针对其甲状腺机能下降的程度，给予适当的治疗，同时给予甲状腺激素，使其恢复到正常状态，不会对工作、学习、日常生活造成任何的干扰。
新生儿甲状腺功能低下原因较多，有可能是孕妇患有甲亢，在孕期服用了过量的抗甲状腺药物，引起新生儿甲状腺功能低下；也有可能是胎儿先天性甲状腺不发育或发育不全；或者异位甲状腺。
