包括了肛门检查。在全麻下进行，操作者将粗约两公分的肠镜，经过润滑之后，插进肛门。一直要到达回盲部，靠近阑尾的部位。然后缓慢退出，一边退出镜头，一边打气体。利于充分暴露周围组织。如果遇到粪便，需要积极的吸净，有利于观察。当退到乙状结肠，直肠后，还可以观察直肠，肛管以及内痔的情况。
用于长期反复拉肚子不好，超过一个月左右就是慢性肠炎。多见的就是伪膜性肠炎或者是过敏性肠炎。就是由于长期使用抗药物引起的。同时注意一下过敏原因导致的过敏性胃肠炎，关键是要找到过敏原，避免在次接触。
宝宝慢性肠炎是肠道感染导致的炎症，大便次数增多及形状的改变，分病毒性肠炎及细菌性肠炎，化验便常规，区分肠炎性质后积极治疗，注意腹部保暖。一般是细菌感染引起的。通常与不洁饮食有关，平时的饮食清洁卫生。
慢性直肠炎可予菌群微生物调节药物治疗，或者进行抗炎治疗，做到三餐定时、定点和定量，不要暴饮暴食，经常吃刺激、辛辣的食物。慢性肠炎要少用一些对胃肠道刺激的药物，以免引起胃肠道的黏膜损伤。
可根据病情口服滴抗生素。中药理气舒肠方治疗慢性期体虚无力，以排粘液为主。慢性直肠炎急性发作时，予以清热解毒、润肠通便。适当休息，进清淡、少渣、营养丰富、无刺激性的食物，并做到心情愉快，劳逸结合。
