沙眼衣原体感染主要通过药物进行治疗。
衣原体是介于细菌与病毒之间的微生物，可感染眼、鼻咽部、子宫颈、尿道黏膜等部位。感染后常见病包括沙眼、结膜炎、泌尿生殖道感染等，衣原体对阿奇霉素、多西环素、四环素或红霉素比较敏感。但是用药剂量需要根据患者具体情况而定，并遵医嘱服用药物。
沙眼衣原体的临床表现主要有两种：一是局部给药，二是系统给药。
可以选择的还有司帕沙星、罗红霉素、克拉霉素、氧氟沙星、左氧氟沙星、四环素等。需要根据病情、药物敏感试验来选用药物。病人和他们的性伙伴应该在他们的治疗结束以前避免性行为，以免交叉感染。
通常情况下，儿童慢性结膜炎用抗生素滴眼液比较好。
儿童慢性结膜炎比较常见，可能是不注意眼部卫生、用眼不良等因素引起的，家长可以在医生的知道下给儿童使用妥布霉素滴眼液、氧氟沙星滴眼液等眼药水比较好，具有抗菌、消炎的作用，能够有效缓解症状。此外还可以用红霉素眼药膏，通常也能缓解儿童慢性结膜炎的症状，通常副作用比较小。
沙眼，一般的起病比较缓慢，所以临床症状的轻重不等，早期的时候可能没有自觉症状，只是觉得有轻微的异物感，以为自己尘沙进入眼睛后引起的不舒服。沙眼在小孩子当中是最常见的，是一种传染性眼疾，可导致眼部不适，严重的还可导致视力受影响，治疗不及时危害是十分大的，因此对于小孩沙眼的症状家长要注意了解，以便能及时发现病情，及时进行治疗，避免带来危重影响。
沙眼衣原体抗原检测阳性，需要口服抗生素治疗，应该保证足疗程，抗生素药物在治疗生殖器衣原体感染的治疗率可以达到90%以上。衣原体还没有出现在抗生素耐药性，所以病人在治疗时不必担心耐药的问题，多参加体育锻炼，提高自身免疫力，注意在患病期间不要同房以免交叉感染。
沙眼衣原体感染可以通过以下方式进行治疗。
1、药物治疗：如果出现了沙眼衣原体，可以通过局部的抗生素来缓解眼睛不适的情况，比如新霉素眼药水、酞丁胺眼药水、利福平眼药水等。病情比较严重的话，可以在医生指导下服用阿奇霉素、红霉素等，能够有效地杀死体内的沙眼衣原体，缓解眼睛的不适。
2、手术治疗：沙眼衣原体感染后，若发生倒睫，即眼睫毛朝眼眶的位置长出来，会对眼睛产生很大的刺|激，可以通过外科的方式进行治疗，从而纠正内翻的眼睑，防止倒睫或眼内翻引起的致盲。
