使用左旋肉碱减肥药可能会引起不良反应，肝肾功能弱的人服用左旋肉碱时经常出现不良反应，过量使用左旋肉碱可能导致腹泻。
左旋肉碱燃烧脂肪并提供能量，这也使人兴奋。因此，服用左旋肉碱可能会导致失眠并影响睡眠质量。如果长时间服用左旋肉碱，高消耗和低摄入会导致营养不良，从而降低身体功能。左旋肉碱可能对肌肉有害，导致肌肉无力、肌肉萎缩等。
左旋肉碱可以减肥。因为左旋肉碱是脂肪的运载工具，当人体剧烈运动的时候，体内的左旋肉碱不能满足需要的时候，补充左旋肉碱，加快脂肪的新陈代谢速度，可以很快地达到减肥的目的，但前提是得进行运动。
左旋肉碱本身属于一种减肥药，但本身并不会直接起到减肥的作用。在运动前1～2个小时服用左旋肉碱是最好的，可以有效的在运动过程中加速脂肪燃烧，达到理想的减肥效果。
要加上运动大概要1个周到2周才能见效，左旋肉碱不是减肥药，它的主要作用是运输脂肪到线粒体中燃烧，是一种运载酶。要想用左旋肉碱减肥，必须配合适当的运动，控制饮食，一般运动员和健身的人运动力大时，才会有用。
左旋肉碱是人体必要的一种物质，婴幼儿奶粉中都有添加，作用是在运动的情况下增加脂肪的消耗和转化，如果不运动是无效的。要减肥，还需运动，饥饿减肥最先消耗的是肌肉，脂肪转化很慢，后期如果摄入同样量食物肌肉少了，日常热量消耗都小了，必定反弹。
