孕酮低是会影响月经的。可以去医院做一下孕酮检测，查明原因后在医生的指导下适当的补充孕酮。平时要注意休息，不要劳累，生活规律，保证睡眠充足，多吃富含维生素的新鲜蔬菜和水果，不要吃生冷辛辣刺激性的食物。
怀孕和好多因素有关系不一定只是月经不调的原因，还是详细检查一下，最直接的关系就是孕妇是否排卵，排卵和好多因素也有关系，环境因素，药物因素，身体其他疾病的影响，你应该测一下基础体温，连续三个月，确实不排卵可以用促排卵的药物治疗。也应该寻找不排卵的原因。
月经不调孕酮太低可通过以下方法进行治疗。
女性出现月经不调孕酮太低的情况，临床上一般通过在医生的指导下服用增加体内孕酮的药物来进行治疗，比如黄体酮软胶囊和雌醇环丙孕酮片。另外，患者还可以到医院检查性激素六项，以此来判断是否存在其他的妇科疾病，比如多囊卵巢综合症，并及时进行针对性的治疗，这样才可以更好的保证女性的身体健康。
孕酮低会造成月经不调，孕酮也是一种性激素，如果分泌减少就会影响月经，可以用人工周期治疗，服用几个月经周期。平时保证充足的睡眠，不要熬夜，充足的睡眠有利于体内激素的正常分泌，体育锻炼。
月经不调并不是必须清宫，而是要到正规的医院做详细的检查。
如果女性月经不调的时候有不均匀的子宫内膜回声，非月经期间异常流血，影响到月经的正常月经，就必须做清宫手术，去除宫腔中的增厚的内膜，然后通过病理的方法来确定有没有什么问题，然后再按照医生的指示进行治疗，以防止月经不调。
日常三餐规律，按时吃饭，多吃蔬菜、水果；经期忌食辛辣、刺激、生冷食物。
