药物流产对身体的伤害小一些。
如果女性选择药物流产，在流产彻底的情况下，药物流产的危害较小，因为不会进行宫腔操作，孕囊会跟着阴道流血排出在外。如果女性选择无痛人流的方式进行流产，进行无痛人流时虽然没有感觉，但是在进行手术过程中可能会直接伤害到自身子宫内膜，从而出现感染的情况，如果流产不彻底，可能还需要再次清宫，对身体的伤害更大。
一般情况下，药物流产和无痛人流分别所适应的患者都各不相同。建议患者根据怀孕的情况，结合身体情况，选择适合的流产方法。具体分析如下：
通常来讲，药物人流，适合怀孕时间在49天之内的早孕患者，避免手术对患者子宫的伤害，全程正确使用的话，一般都可以顺利完成流产。而无痛人流是以普通流产手术为基础，配合麻醉程序，减轻手术过程中的疼痛，适合于怀孕时间超过药物流产范围，或者身体有其他原因无法进行药物流产的患者。所以建议患者根据怀孕情况和自身情况选择合适的流产方法。
无痛人流和有痛人流相比，无痛人流就是打麻醉后做一点感觉都没有，有痛人流就是不打麻醉能感觉到痛，但是两者都是对宫腔进行刮宫都有损伤子宫内膜的。药流就是吃药，如果流干净了可以不用清宫手术，没有流干净就需要进行清宫相对前面两者损伤要小一些。
药物流产痛苦小，避免了器械性手术操造成的恐惧和伤害，但药流后存在阴道流血时间长及流产不全需进行清宫术等。相对而言，无痛人流具有镇痛效果强、完全流产率高等特点。
通常情况下，并不能很好地判断普通人流和无痛人流哪个好，需要结合患者的实际情况进行选择。
普通人流的优点是不必采取麻醉的方式，然后医生会根据患者的情况进行清宫处理，从而不容易造成刮宫过深，但是缺点是疼痛症状可能会过于剧烈，部分患者不容易接受。而无痛人流的优点是患者通常不会觉得疼痛，在睡眠当中就可以把手术完成，但是缺点是因为没有疼痛感，医生在清宫的时候，容易操作不当，可能会损伤子宫内膜。因此两者各有优缺点，所以并不能单纯判断普通人流和无痛人流哪一个更好一些。