一般来说，阴茎上长肉芽可以使用激光或者冷冻的方式切除。
阴茎有肉芽可能是炎症刺激，赘生物或是湿疣的情况，这是一种性传播疾病，确定是尖锐湿疣引起的，建议可以选择用激光或者冷冻的方法，去除局部的疣体。建议患者这段时间要禁止性生活，建议营养均衡，不要吃辛辣刺激食物，局部清洁卫生，属于良性病变，注意观察即可。
阴茎上长肉芽是尖锐湿疣，具体分析如下：
由于患者一个月内有不洁的性接触史，感染了人乳头瘤状病毒引起的尖锐湿疣引发阴茎上长肉芽。建议患者出现相应症状后及时到医院进行检查，明确病因后进行针对治疗。如果是尖锐湿疣，可以使用干扰素软膏来治疗，以免复发。
建议患者在日常生活中注重私处卫生的护理工作，保证皮肤清洁卫生，穿全棉内裤，治疗期间不要有性生活，避免发生细菌感染。
到正规医院检查，做醋白实验即可。如果确诊为尖锐湿疣，可以做激光治疗，治疗后口服阿昔洛韦，多糖蛋白，禁房事。锻炼身体，提高抵抗力，减少复发。龟头上长肉芽状的东西临床上多是由于尖锐湿疣引起的，尖锐湿疣会导致病人的生殖器上长出小而柔软的淡红色丘疹，针帽或米粒大，逐渐增大，且数量逐渐增多，成为乳头瘤样、菜花样、鸡冠样或蕈样的赘生物。
这是性病的症状，阴茎有菜花状肉芽是尖锐湿疣症状的一种，去医院行体格检查、醋酸白试验等检查确诊，必要时行激光术或冷冻术后行组织病理检查确定性质，平时注意局部清洁卫生，多喝水，忌烟酒及辛辣刺激食物。
阴茎肉芽的病变非感染因素多是由于包皮过长，清洁不够，包皮和龟头之间的不洁之物，即包皮垢，便会堆积起来，刺激局部的包皮和粘膜发生炎症。应注意局部卫生情况，及时到正规的专业的男科医院做相关检查，明确病因，针对性治疗，以免影响生活质量。
主要是保持局部清洁、干燥。可每天用等渗生理盐水清洗，疼痛者可口服止痛药，给予精神安慰。并发细菌感染者，可外用抗生素药膏。局部疼痛明显者，可外用药膏或口服止痛药。