若月经规则，但停经39天未见孕囊需警惕是否胚胎发育不良、胚胎停止发育。需动态观察血hcg和B超结果明确诊断。若平时月经不规则，周期延长，推迟7天或以上，则停经时间和实际受孕时间不相符，停经40天但实际受孕时间不足40天，有可能做B超未见孕囊。可隔段时间再次复查B超了解胚胎发育情况。
一般来说，孕妇45天B超检查没有发现孕囊，可以通过检查血hcg和孕酮来确定是否存在异常。如果hcg低于2000U/L，可能是因为月经周期退后不正常，或者是排卵延迟导致了受精卵着床晚引起的生理症状。可以一周后复查彩超，看看有没有怀孕囊。但是hcg超过5000U/L，伴有异常的包块，可能是宫外孕引起的，一般要及时就医。
怀孕时间比较短，检查不出来孕囊也是正常的，建议注意卧床休息不要做剧烈的运动，怀孕的前三个月胎儿发育不稳定的，最好等到怀孕三个月的时候再去检查比较好一定要加强身体的营养。注意下是否有出血或是疼痛加剧的情况，如果有要及时检查。
在备孕期间，做B超检查时子宫内膜17mm，应该是宫内孕的可能性大，一周以后再去复查。在怀孕早早期，虽然用验孕棒验尿已经显示是怀孕了，但做B超时不一定在宫腔内就已经有孕囊了，因为精子与卵子结合以后，需要一定的时间才会回到宫腔内着床，并且慢慢发育成长形成孕囊。
首先来说第一个因为月经已经停了很长时间了，如果是怀孕是应该能查到的，那么需要第一个是做一下血液方面的检查，动态观察血hcg和子宫附件超声情况，正常宫内孕血hcg是呈隔日翻倍增长的，宫外孕增长慢，如果左侧卵巢无回声进一步增大，宫内还是没有孕囊，可以确定是宫外孕。
停经40天b超未见孕囊考虑是排卵延迟，受精卵着床晚，还考虑是自然流产或者宫外孕的情况。正常月经规律的女性停经40天，如果确认已经怀孕，在宫腔内应该可见到大小在1.5-2cm之间的孕囊。