甲状腺肿瘤术后可能会出现一些不良反应，首先是因为手术时嗓子沙，导致喉返神经受损。肿瘤的生长位置和手术操作技巧有关。
还可能会造成低血钙症，也就是所谓的副甲状腺机能低下。甲状腺肿瘤的发生是由于甲状腺肿瘤的侵袭，或是由于局部的血液供应发生变化，从而造成甲状旁腺的功能受损，从而出现手足麻木、抽筋等症状。如果是由于甲状腺肿瘤导致了甲状腺机能亢进，需要尽早进行外科切除。
甲状腺结节临床发病率很高，多数结节不需要手术。只有高度怀疑是癌性结节、结节合并甲状腺功能亢进、比较大的结节压迫气管影响呼吸或良性结节在观察中，内部有出血改变。患有甲状腺结节不要恐慌，由于B超的普及与技术的提高，很小的癌性结节都会被及时发现，诊断的准确率在90%以上，基本上能够达到早期发现，早期治疗。
甲状舌骨囊肿或甲状舌管瘘处常因反复感染而形成较多的瘢痕组织，给彻底切除病变组织带来困难。未成年的病人因组织发育不完全，解剖层次不清楚，手术后容易复发。甲状舌管囊肿和甲状舌管瘘切除术用于颈部囊肿、瘘管手术治疗。甲状舌骨囊肿为先天发育异常所致。如果囊肿位于婴儿舌根部可能引起窒息。甲状舌骨经舌骨前方向下至甲状腺。其囊肿发生的部位多在舌盲孔与舌骨间，舌骨与喉间，喉下部气管前等部位。
甲状腺腺瘤是甲状腺常见的良性肿瘤，一般手术切除即可治愈，术后预防感染。注意休息，避免受凉，预防感冒。饮食上注意吃清淡易消化食物，如：米粥、菜汤、馒头、包子、炒菜等。不吃辛辣、生冷、油腻等食物，忌烟酒。
多发良性结节，以观察为主，结节较大时会压迫气管，或病变于胸骨后时，也可以考虑手术，如甲状腺乳头状癌，主要采取手术，包括半切及全切术，大部分手术效果较好，可得到康复。
手术后两个月不能去烫发染发，因为烫发染发是用一些化学物质，对身体刺激很大，而且染发容易致癌。还是要保持良好的生活习惯，并且防治复发和转移。烫发尽量少做，而术后两个月尽量多休息，饮食上加强营养，适当使用些中药防止癌症复发就可以了。