甲状腺囊肿治疗主要依据甲状腺囊肿的肿物多少、大小来决定。较小甲状腺囊肿无需治疗，较大甲状腺囊肿或者短期内迅速增大的甲状腺囊肿。由于甲状腺囊肿多数是良性，手术切除之后，一般无需再进行其它方面的治疗。但是如果甲状腺囊肿较多，甲状腺组织也进行了部分切除，可能造成一部分病人甲状腺功能减低，术后还需配合进行甲状腺激素的治疗。
甲状腺双面叶出现囊肿，大部分是良性疾病。
结节性甲状腺肿导致部分分泌功能随着结节的增大，发生囊内出血，就会成为甲状腺两侧叶的囊肿。囊肿比较小，不用处理，定期观察即可。双侧叶形成大囊肿或囊室性肿瘤，如果出现压迫症状或有困难，应进行手术切除，必要时可穿刺吸囊液，减少症状。因此，出现双侧叶甲状腺囊肿的患者应到正规甲状腺外科或专科医生进行详细咨询和诊断，并选择适当的治疗方法，以消除或治疗甲状腺双侧叶的囊肿。
如果甲状腺良性囊肿是小鸡蛋大小，通常要手术。手术后要坚持吃药，甲状腺囊肿有良恶性之分，良性甲状腺囊肿都采用保守中医治疗，中医治疗也比较认同，只要及时去医院治疗，甲状腺囊肿是可以恢复的。
甲状腺囊肿突然增大有可能是恶性病变，建议去内科做个甲状腺彩超排查肿块性质，甲状腺囊肿的危害是会引发急躁、胸闷、甲状腺肿大及眼球突出等症状，巨大疼痛的囊肿可造成吞咽、疼痛、呼吸困难等，还会出现颈淋巴结转移，引发痛苦不适感。尽快去就医，在医生指导下用药，多吃富含碘的食物，如海带，紫菜等。
如果囊肿比较小，建议定期复查颈部彩超。如果囊肿比较大，建议外科手术切除治疗，效果比较好，一般不会有副作用。甲状腺囊肿是头颈外科比较常见的疾病，这是一种良性病变，囊肿小的多数病人没有临床症状，多是在体检时被发现，如果囊肿比较大的，颈部有明显增粗的表现。
一般情况下，卵巢囊肿可以通过活检来确认囊肿是否为良性，具体内容如下：
卵巢囊肿是良性还是恶性，通常要到医院做妇科肿瘤标记，如果是良性的，那就是有一定的几率。正常情况下，有恶性的可能性，比如血液ca125升高，或者是子宫内的巧克力囊肿，属于良性的。因此，要做好术前做一次简单的组织学分析，确定卵巢囊肿的具体情况，做简单的病理检查是不准确的。
