亚急性甲状腺炎等，一般数周或数月后减轻，病程6-12个月，反复发作者甚为罕见。
一旦出现了慢性化过程，则会对患者带来很大的危害，严重时还可导致死亡。如亚急性甲状腺炎反复发作，有可能是糖皮质激素减量过快，停药过早，此症若症状较轻微，可应用非甾体类消炎止疼药，疼痛症状好转即可，如仍伴发热，血沉升高十分明显，可再应用糖皮质激素，以改善症状。对于亚急性甲状腺结节或囊肿者，一般不建议进行治疗。待血沉恢复正常后，再逐步减量，总疗程必须超过6-8周，如停药太快，太早，极易又导致亚急性甲状腺炎的复发。因此对于已经发生了亚急性甲状腺炎的患者，应该尽早进行治疗和护理，避免造成不必要的损失。亚急性甲状腺炎为病毒感染变态反应性炎症，发病前，许多病人都有上呼吸道感染病史。
目前的治疗对消除该病尚无可靠方法，针对甲状腺大小和甲状腺功能异常可作对症处理。如甲状腺功能正常，甲状腺小、无明显压迫症状可随诊观察，若肿大的甲状腺压迫邻近器官或影响外观，有人提议服甲状腺激素可使甲状腺缩小，而且多数病例最终甲减，早期用药比最终好。
甲状腺炎的治疗要看是什么类型的甲状腺炎。
急性化脓性甲状腺炎、亚急性甲状腺炎和急性甲状腺炎是按照时间的紧迫程度来划分的。桥本甲状腺炎、萎缩性甲状腺炎、无痛甲状腺炎、产后甲状腺炎等都属于慢性甲状腺炎，其中急性化脓性甲状腺炎要做抗炎症处理，如果有必要的话可以做外科切开引流，但由于引流的危险性很大，所以要与病人和病人的家人进行充分的交流。至于亚急性甲状腺炎和副甲状腺炎，一般都是可以自行治愈的，只要配合医生进行相应的治疗就可以了。
一般情况下，桥本甲状腺炎可采取使用药物、手术治疗等方法治疗桥本甲状腺炎，具体内容如下：
当桥本氏甲亢病人的甲状腺机能不正常时，必须进行手术。不过对于桥本甲状腺没有造成甲状腺机能不正常的情况，通常会采取药物疗法，而不会采取外科和放射疗法。桥本氏甲亢，主要是由于甲亢的破坏性抗体升高，造成了甲状腺的损伤，从而造成了甲状腺机能下降。但如果做了外科和辐射，就会对甲状腺的损伤，从而导致甲亢的病情恶化。
甲状腺瘤患者通常可以通过手术进行治疗。
甲状腺腺瘤是甲状腺最常见的良性肿瘤,多发生在40岁以下的女性患者。按形态可以分为甲状腺乳头状瘤和滤泡型甲状腺瘤。甲状腺瘤是目前临床上最常用的治疗方法，因为甲状腺瘤有癌变和甲状腺功能亢进症的可能，所以不管肿瘤大小，都应该选择患侧腺叶切除或者腺叶次全切除。单纯腺瘤摘除术后可能会留下小腺瘤，以后可能会复发。
