可用以下方法进行治疗。手术治疗：利用咽后壁组织瓣增加软腭长度，利用咽侧组织瓣缩小咽腔宽度，以改善腭咽闭合。对症治疗：对腭隐裂的患儿可严密监护，只有当出现喂养、听力或语音问题时才考虑进行腭裂的修复。
注意事项有应防止患儿用手搔抓伤口、拔掉唇弓或将手伸进口腔。必要时用小夹板使双上肢制动。护士小姐每日用消毒棉签清洁伤口，清除血痂和污物，保持局部清洁。家长不应自己擦拭伤口。
唇腭裂多是基因遗传性疾病，也有的是妊娠早期病毒感染、饮酒、药物及放射线引起的基因突变导致的。等宝宝大点可以采取手术的治疗方式，术后多休息，使用一些消炎药，预防消炎，伤口定期用消毒液消毒，不会影响美观的。
可用以下方法治疗。对症治疗：对5至10岁的腭裂患者，实施在腭裂整复的同期行华西咽后壁增高术，以助腭咽闭合率的提高。手术治疗：利用咽后壁组织瓣增加软腭长度，利用咽侧组织瓣缩小咽腔宽度，以改善腭咽闭合。动脉岛腭瓣手术治疗：大多选择在患儿3-6岁之前进行治疗。唇裂修复手术治疗：一般单侧唇裂修复手术在患儿3-6个月进行，而双侧唇裂手术多在6-12个月左右进行。
遗传因素，唇腭裂的患者往往在其直系或旁系亲属中也可发现类似的畸形。营养因素，各种因素导致的孕妇维生素缺乏都会引起胎儿唇腭裂的发生。感染损伤，内分泌紊乱以及药物因素都会导致胎儿畸形。孕妇频繁接触x线或微波等，都有可能引起胎儿发育异常而导致唇腭裂的发生。有研究表明，吸烟饮酒也会造成胎儿唇腭裂的发生。
