对良性、非赘生性、囊肿的直径大小在5厘米以内，又无任何症状的卵巢囊肿，不必作特殊处理，大部分可被机体吸收，自然消失。如果囊肿的大小超过5厘米，定期观察时有发展趋势，或囊肿发展快、增大明显，则应入院手术治疗。手术为卵巢囊肿切除术，输卵管卵巢切除术，附件及全子宫切除。
可能存在多囊肾，这个有些是先天性的疾病，是否需要治疗还是看囊肿的进展情况，如果只是一点点大并没有进展，这个是不需要治疗的。建议还是密切观察症状的变化，定期到医院复查肾脏B超，肾功能都正常的，也没什么不舒服，就可以不用。
可以治好的，卵巢囊肿在一般无症状下可以保守治疗，可试用一些中医治疗方法，如果囊肿蒂扭转，会产生剧烈疼痛，合并感染，囊肿破裂囊肿生长迅速，体积增大就必须手术治疗，所以经常复查。
肾囊肿包括单纯性肾囊肿和肾多发囊肿，还有就是多囊肾。单纯性囊肿和肾脏多发小囊肿，多不严重，首先肯定的是多发小囊肿为良性病变。如果囊肿增大明显，超过5CM，可以行手术治疗，目前临床上可以行后腹腔镜肾囊肿去顶术，手术效果好，恢复快。如果是双肾多囊肾，随着年龄增大，最终导致慢性肾功能衰竭，预后较差。
引起卵巢囊肿的性质很多，发生的原因各不相同，常见的生理性囊肿，比如卵泡或者排卵后形成的黄体。、卵巢滤泡囊肿，是成熟卵泡无排卵和闭锁卵泡持续存在，卵泡液潴留而致。卵巢黄体囊肿，成熟卵泡在排卵后形成黄体，在血管形成期，血液流入宫体腔内形成黄体血肿。
