通常来说，慢性肠炎肚子疼吃枯草杆菌二联活菌肠溶胶囊、阿托品、山莨菪素等药。
慢性肠炎肚子疼可能是由于长期的炎症所致的肠神经受到了刺激导致的，可以口服枯草杆菌二联活菌肠溶胶囊等调节肠道菌群的药物，还可以配合阿托品、山莨菪素等解痉镇痛类的药物。平时也要避免食用过多的生冷和辛辣的食品，避免对肠胃造成刺激，导致病情恶化。
慢性肠炎主要症状无特异性，多数有不同程度的消化不良症状，主要有反复性的腹部胀痛，疼痛部位不确切，通常发生在饭后，大便稀薄并带有黏液，有的甚至带有少量脓血，排便次数增多，每日2次到3次或更多。
慢性肠炎表现为腹部疼痛和大便性质变化。慢性肠炎的腹部表现为间歇痛、隐痛、反复发作，疼痛轻微，日间多，夜间轻。慢性肠炎的大便特征是一天三到十次，多数是稀软便，少部分是水样便，有时还会出现腹泻和便秘的症状。另外，也有一些患者会有腹部的肿块和轻微的疼痛。氧氟沙星胶囊等抗生素是目前临床治疗慢性肠炎首选的药物。
慢性肠炎是细菌，病毒，真菌或寄生虫引起的小肠和结肠的炎症。表现为腹痛，腹泻，稀水样便或粘液脓血便。小儿肠炎多因不洁东西所引起，故预防最要紧的是食物之清洁及保存安全。
腹泻一般是由于饮食不洁导致了胃肠的功能紊乱所致，也有可能是由于有肠炎的存在，经常发生腹泻，有可能是由于有慢性肠炎的可能。建议可以做一次大便的常规检查，如果是有肠炎需要选择敏感的消炎药物进行治疗，也可以找中医医师把脉后中药进行调理。
一般情况下，可以通过临床症状、检查结果等来判断慢性肠炎，具体内容如下：
1.临床症状：如果患者患有慢性肠炎，可能会出现腹痛、腹泻、粘液脓血便等不适症状，病情比较严重时，患者还可能会出现发热、恶心、呕吐等表现。
2.检查结果：如果患者患有慢性肠炎，通过纤维结肠镜检、便常规检查、血常规检查等方式，通常能发现相关数值的变化，从而确诊患者的病情，并针对性地进行治疗。