子宫内膜异位卵巢巧克力囊肿可以怀孕，但是怀孕的几率比较低。如果巧克力囊肿的周围没有粘连，输卵管通畅，卵巢有排卵，就能够怀孕。如果巧克力囊肿形成的时间较长，囊肿内反复出血，输卵管卵巢周围粘连严重，输卵管伞端粘连包裹，输卵管不通畅，就不能够怀孕。
因为卵巢巧克力囊肿手术之后具有复发性，如果在临床上计划怀孕，建议手术之后尽快准备怀孕；如果还没有计划怀孕，术后要给予继续治疗三个月到半年的时间，主要是避免复发。
手术不是很简单，巧克力囊肿一般是子宫内膜移位导致的；输卵管积液是由于输卵管炎症导致的输卵管闭塞，使输卵管内的分泌物流不出来集聚在输卵管。巧克力囊肿和输卵管积液一次麻醉两个疾病一起手术，费用根据医院的级别不同收费标准不太一样的。
子宫内膜异位症是一种常见的妇科疾病，对身体健康又严重的影响，而且还有可能导致女性的不孕，因此及时的发现和治疗子宫内膜异位症是非常重要的。目前，对子宫内膜异位症的检查通常采用以下三种方法：B超检查、X线检查和腹腔镜检查。
巧克力囊肿一般是不会影响输卵管不通的，两者之间没有直接关系，排卵如果正常就说明输卵管没有堵上，如果还不放心，可以在月经干净以后去医院检查输卵管的通畅情况是否正常。
子宫肌瘤是良性的肿块，一般小的肌瘤无需治疗，大于５cm子宫肌瘤是可以采取手术治疗，巧克力囊肿是子宫内膜异位症导致，可能出现疼痛，破裂的可能，需要到医院手术治疗。不要吸烟酗酒，月经时期不要吃冰冷的食物．注意少吃含有激素类的食物。
