左附件区囊肿根据肿物性质、持续的时间、肿瘤标志物有没有升高等，综合决定下一步治疗方案。需要注意如果是第一次发现的囊肿，超声提示的是单纯囊肿，单纯囊性的肿物，肿瘤标志物都正常，可观察2-3个月，但要注意2-3个月后要复查超声。如果肿物持续存在，建议手术治疗。因为卵巢囊肿有一定恶变的几率，如果发现囊肿不是单纯囊肿，囊肿里面有乳头，或者其他情况，以及肿瘤标志物升高，则需要手术治疗，而不可以保守治疗。
左侧附件区囊肿如果小于五厘米可以药物治疗，如果大于五厘米应该及时进行手术治疗。造成左侧附件区囊肿的原因一是炎症所引起，二是内分泌失调所造成，确诊后在进行治疗。
女性检查彩超出现双附件区囊肿，通常要考虑是由于体内雌孕激素刺激，而引起的普通囊肿。或者是由于子宫内膜异位到双侧卵巢，而引起的卵巢巧克力囊肿。但也不排除是由于盆腔炎症刺激，而引起的附件炎性囊肿。
右侧附件囊肿，可以做腹腔镜手术治疗。如果考虑是良性的卵巢囊肿，绝经前的女性可以考虑手术剥出，如果考虑是恶性的肿瘤，那么就要做分期手术或保留生育功能的手术。
附件区的囊肿主要是包括输卵管的系膜囊肿以及卵巢囊肿。输卵管系膜囊肿为良性。卵巢的囊肿，分为巢分为生理性及病理性囊肿。生理性的囊肿，发生在排卵后，黄素化囊肿，多小于4cm，可自行消失。病理性囊肿分良性、交界性及恶性，正常百分之八十五以上都是良性的，少数为恶性。
无论是哪一侧上的附件囊肿，只要体积不大没有超过五公分，肿瘤指标检查结果在正常范围之内，可给予定期观察。特别是对于卵巢黄素囊肿，一般无需特殊处理，多可自行吸收。但对于存在卵巢囊肿破裂或蒂扭转的，临床出现急腹症的，需要急诊行剖腹探查手术。
