一般情况下，轻微甲减可通过日常护理、使用药物等措施进行治疗，具体内容如下：
甲减的治疗方法是以甲状腺激素代替疗法为主，优甲乐和甲状腺激素篇是比较常见的药物。首先是低剂量，然后是通过全身的表现和化验的结果，逐步增加，直至所有的病症都没有了，t3、t4、ft3、tsh都会回复到原来的水平。从那以后可能也需继续服用，避免随意中断，不然1-3个可能就会有复发的情况。日常生活中要多吃些低脂肪食物，多补充碘。
严重，甲状腺功能减退是属于慢性的疾病，一般需要长期的药物治疗来控制病情的稳定，需要定期复查血甲状腺功能的指标，根据指标来调整药物的剂量。一般每月都是需要复查一次。如果长时间不复查，那会有引起血甲状腺功能指标波动的改变。
如何处理甲减和亚临床，应根据病人具体情况决定。
如亚临床甲减患者，通常无症状，也无体征，常因查体后被人发现，因此，绝大部分亚临床甲减无需处理。对于甲减症患者来说，可以选择药物进行辅助治疗，比如使用左甲腺素钠或者右甲素，这都能够取得较好疗效。但若伴有较严重的甲减症状如乏力、便秘等，且Tsh大于10毫国际单位每升，病人再次合并动脉硬化，血脂异常和甲状腺相关抗体升高的问题，需要处理。因此，亚临床甲减和甲减都应该进行治疗，而不能简单地把二者对立起来。
中医一般不能治好甲状腺功能减退。
人体的新陈代谢紊乱主要是因为甲状腺激素的合成，分泌的降低，生理作用的缺乏。目前西医常用的治疗方法是使用优甲乐，可以通过服用外源性的甲状腺激素来治疗。
而中药则以调理腹部肿胀、调和阴阳、排毒为目的，达到标本兼治、缓解病症、缓解患者疼痛等目的。中医与西医各有利弊，不过中医和西医的治疗方式通常可以采用中西医相结合的方式。除了服用中成的药物外，还可以降低西药的不良反应，从而彻底改善患者的病情。
一旦确诊了甲减都要立即的治疗。一般选择口服药物进行治疗的情况比较多。开始的治疗的时间越早越好，甲状腺发育异常的病人，需要终生的治疗。药量要从小剂量开始，逐渐地增加。
中医治甲减能减轻甲减患者畏寒、无力、困倦等部分症状，但不能对甲减进行病因方面的治疗。
甲减患者一般都有不同程度的营养不良和贫血，如果不进行有效的营养支持会导致并发症发生。甲减多因本身合成甲状腺激素太少所致，由此导致人体出现一系列的低代谢症状，因此，治疗就是外源性地补充甲状腺激素的需要，常用药有左甲状腺素钠片等，左甲状腺素钠片初治时应从小剂量入手，循序渐进地增加剂量，直至甲功恢复正常。服用期间不要让病人吃辛辣食物，以免影响疗效。甲功恢复正常后，每6个月至一年检查甲状腺功能，观察现有药物剂量能否保持甲状腺功能正常。如果已经出现了甲亢症状就应该及时服用抗甲状腺药和降钙素原进行对症处理，否则会影响病情发展。甲减病人应引起重视甲减属于终身性疾病，需终生服药治疗，不能随便停药。
