此类疾病的治疗首先应该确定病人目前的甲状腺功能状态，如果仅仅是抗体增高，而甲功三项的水平均正常，暂时是不需要治疗的。需要适当控制摄入碘的含量，应该避免吃海带紫菜以及碘盐，并做好定期的复查，根据复查的结果来判断下一步的治疗方案。
桥本甲亢需要治疗，具体分析如下：
桥本甲亢是一类累及甲状腺的异质性疾病。由自身免疫、病毒感染、细菌或真菌感染、慢性硬化、放射损伤、药物、创伤等多种原因所致甲状腺滤泡结构破坏。其病因不同，临床表现及预后差异较大。桥本甲亢患者的早期治疗以减轻炎症反应及缓解疼痛为目的。无症状或症状较轻者可不予治疗，若甲状腺肿大明显或有甲减等，需采取药物治疗或手术治疗。
桥本氏甲亢，是指桥本氏甲状腺炎合并甲状腺功能亢进。桥本氏甲状腺炎又称为慢性淋巴细胞性甲状腺炎，在发病过程中，出现一过性的甲状腺功能亢进，但是，最终转归为甲状腺功能减退症。甲状腺功能亢进症程度不严重，给予温和的抗甲亢药物治疗。
桥本氏甲亢严格来讲，并不是因为甲状腺本身功能过于亢进而出现和甲亢相关的临床表现，所以如果选择抗甲状腺药物治疗的时候，注意剂量一定不要太大，不然有可能大剂量抗甲状腺药物会让患者比较快的出现甲状腺功能减退的情况。
采用针药结合，即根据辩证，确定体质，可以针刺，艾灸结合中药方剂调理，具体疗程要根据病情而论，中药及针灸一般采用活血化瘀，行气止痛的方药及穴位手法，但一定要辨证论治。
桥本甲状腺炎一般是桥本甲亢和桥本甲减，桥本甲减一旦出现甲亢，就不会再发生甲亢，如果怀孕后出现甲亢，有可能是桥本甲减在服用左甲状腺激素替代治疗后，没有定期监测甲状腺功能，无法判断甲状腺激素替代治疗是否过量，这时候怀孕可能会出现甲亢。为了避免出现这种情况，应定期测量甲状腺功能，并在医生指导下调整左甲状腺激素的剂量替代。