亚急性甲状腺炎一般不会遗留永久性甲状腺功能减退。
因为亚急性甲状腺炎是一种自限性疾病，即使不治疗，也能自行治愈。亚急性甲状腺炎一般在发病前1-3周出现病毒感染史，此外还可能出现甲亢期、甲减期以及甲状腺功能正常期。甲亢期和甲减期一般不需要吃药，只需要定期复查甲功就可以了，如果颈部疼痛严重，可以口服非甾体类抗炎药，如果出现发热，血沉增快等症状，可以使用激素治疗。
在出生之后可以给孩子抽足跟血检查，因为通过足够的血能发现孩子是否有甲状腺功能减退，也就是临床上常说的甲减，因为这种疾病会影响胎儿的智力。暂时性甲减一般是由母体存在的抗甲状腺抗体，通过胎盘影响胎儿，同时也会造成甲低，一般三个月之内会逐渐的消失。
判断甲减是永久性还是一过性主要看药物治疗后能否恢复甲状腺功能。经过药物治疗后甲状腺功能恢复，或者是亚甲减导致的就是一过性甲减，永久性的甲减需要终身服用药物来维护甲状腺功能，甲减的治疗方法主要是药物治疗，通过药物来补充人体不足的甲状腺激素，患者在治疗的过程中需要按时复诊，根据复诊的结果来适当的调整药量。及时到医院确诊甲减产生的具体原因，补充左甲状腺素片，需要适当的补充体内的碘，甲减患者往往伴有骨质疏松，在饮食上需要注意补充钙。
甲减何时需要口服甲减，要看具体的临床表现和血液学的变化。
首先，亚临床甲减是甲减的早期征兆，并非亚临床甲减都要进行手术，亚临床甲减属于妊娠期间，或是表现为怕寒、反应缓慢、大便等，或是检测到的促甲状腺激素超过10μg/L，同时存在着甲状腺有关的抗体，患者的血脂不正常，并伴随着动脉硬化等，这些都属于亚临床甲减的范畴。
当血液中甲状腺激素的水平下降就可以诊断是甲状腺功能减退。进一步检查，包括甲状腺功能，甲状腺自身抗体，甲状腺同位素扫描，心电图，心脏彩超等，确诊是甲减，可以用甲状腺激素替代治疗，同时查找病因，进行去除病因治疗。
