如何处理甲减和亚临床，应根据病人具体情况决定。
如亚临床甲减患者，通常无症状，也无体征，常因查体后被人发现，因此，绝大部分亚临床甲减无需处理。对于甲减症患者来说，可以选择药物进行辅助治疗，比如使用左甲腺素钠或者右甲素，这都能够取得较好疗效。但若伴有较严重的甲减症状如乏力、便秘等，且Tsh大于10毫国际单位每升，病人再次合并动脉硬化，血脂异常和甲状腺相关抗体升高的问题，需要处理。因此，亚临床甲减和甲减都应该进行治疗，而不能简单地把二者对立起来。
一般情况下，轻微甲减可通过日常护理、使用药物等措施进行治疗，具体内容如下：
甲减的治疗方法是以甲状腺激素代替疗法为主，优甲乐和甲状腺激素篇是比较常见的药物。首先是低剂量，然后是通过全身的表现和化验的结果，逐步增加，直至所有的病症都没有了，t3、t4、ft3、tsh都会回复到原来的水平。从那以后可能也需继续服用，避免随意中断，不然1-3个可能就会有复发的情况。日常生活中要多吃些低脂肪食物，多补充碘。
对于单纯甲状腺肿引起的甲状腺功能减退，可靠而适宜的补碘治疗。因为人们自己分泌这种东西，只是因为分泌的太少，所以需要补充一点，只要定期监测甲状腺功能在正常范围内。
甲状腺功能减退的时候，身体内的代谢本身就是会有异常的，会有粘液性水肿，表现为身体肥胖，替代治疗恢复了后，粘液性水肿就会渐渐消退，体重增加的情况就会自然渐渐恢复的，当然想减肥，可以控制饮食能量摄入和加强锻炼，对甲减的恢复也是有益的。
甲减可服用药物治疗，甲状腺激素药物与人体甲状腺分泌的甲状腺素结构相同，服用后不会影响机体功能，对肝肾功能无不良影响，可以长期服用。甲减开始治疗后，应每个月检查一次甲状腺功能，及时调整用药剂量，以长期维持治疗。
