可以通过药物、手术等方式治疗甲亢突眼症。
对于突眼的药物治疗，可以选择强的松等皮质激素，但作用缓慢，病程长，副作用也多。还有一些其它的免疫抑制剂，比如环磷酰氨，也可以起到一定的效果，不过副作用会比较大。除此之外，云克治疗也可以用来改善突眼的症状，但是效果并不是很好。对严重的突眼症可以通过外科手术来进行治疗，但其效果并不明确。对于突眼症较严重的患者，可以采取其它的治疗措施，以减轻眼窝内的压迫，并配合换血疗法。
中医治疗甲亢病通常是采用理气舒郁、化痰消炎等方法。
甲亢在中医学中属于“瘿症”的范畴。中医上一般分为肝郁气滞、肝郁化火、气滞痰凝、气阴两虚等类型。因此，需要进行辨证治疗。中医治疗甲亢讲究的是理气舒郁，化痰消炎，痰结血瘀的治疗以理气活血、化痰消炎为主，而肝火旺盛型则以清肝泻火为主，而心肝阴虚型则以滋阴养精，宁心柔肝为主。
一般情况下，甲亢的同位素碘治疗就是碘131治疗，管用。
当服用碘131后，甲状腺细胞就会摄取碘131，碘131释放的射线就会破坏甲状腺细胞，甲状腺破坏后，分泌甲状腺素的能力就会大大下降，从而起到治疗作用。因为身体组织中只有甲状腺细胞能够摄取碘，而碘131属于放射性同位素。绝大多数甲亢患者只需一次碘131治疗就可以治愈。
所以对于抗甲亢药物不能治愈或对甲亢药物不耐受的患者，碘131治疗是非常有效的治疗甲亢的手段。
放射性碘治疗甲亢，效果比较好，具体内容分析如下：
放射性碘治疗甲亢一般需要3-6个月才能见效，特点是见效快，而且效果比较好。但可能会导致甲减，甚至是终身的甲减，需要终身服用优甲乐等药物。根据统计结果，放射性碘治疗甲亢的5年内，终身甲减患者可达60%以上，而且放射性碘治疗甲亢对生育有一定影响。所以放射性碘治疗甲亢是建立在药物治疗无效的基础上，不孕或不想生育的患者可以考虑采取放射性碘治疗的方式来治疗甲亢。
用中医治疗甲亢可以通过药物治疗来改善。
中医理论上说，甲状腺功能亢进与肝郁气滞、气郁化火有关系，肝郁气滞、气郁化火，这就是因为肝郁气滞、气郁化火，火旺会消耗气阴，造成阴虚火旺、气阴两虚之证，并伴有血瘀痰浊。在甲亢前期，主要表现为痰气交阻、瘀而化火，临床上可用消肿散、平亢等药物配合使用。在中期，主要表现在痰、血、瘀、消痈散、血府逐瘀汤等方面。在治疗的过程中，如果患者的身体状况会有气阴两虚、肝血不足等情况，可以选择益气养阴、补虚。如果是桥本氏症，那么可以通过白芍、藤类药等药物来进行调理，因为病人自身的抗体比较高。
优势是治疗过程简便，不用开刀，不影响病人的外观，费用低，症状缓解率快。它的弊端可能导致生育功能改变，甲亢易变成甲减，会引起多种并发症，头晕，恶心呕吐，甲状腺局部肿痛。
