一般来说，先天性甲状腺功能低下症的原因有孕妇孕期饮食缺碘、宝宝甲状腺发育不全、母亲服用了抗甲状腺的药物、母亲本身有自身免疫性疾病。具体分析如下：
1、先天性甲状腺功能低下症的原因有孕妇孕期饮食缺碘，进而可能会导致胎儿在胚胎期就因为碘缺乏。
2、先天性甲状腺功能低下症的原因有宝宝甲状腺发育不全，进而可能会导致胎儿在胚胎期就因为碘缺乏。
3、先天性甲状腺功能低下症的原因有母亲服用了抗甲状腺的药物；进而可能会导致胎儿在胚胎期就因为碘缺乏。
4、先天性甲状腺功能低下症的原因有母亲本身有自身免疫性疾病，影响了宝宝的甲状腺功能。进而可能会导致胎儿在胚胎期就因为碘缺乏。
有76%的人会有抑郁的表现，比如无助，往往先于身体的表现。
有些病人还会出现幻觉，幻想等心理疾病。在做完手术之后，还可能会导致患有抑郁症，如甲状腺炎、长期服用锂盐等。与此形成对照的是，约10%的忧郁症病人存在某种程度的低甲状腺激素，并且经常出现亚临床症状。无征兆的自体免疫性甲状腺炎，在接受锂盐疗法的病人和分娩病人中，都会出现轻度的甲减，这些都会使病人出现忧郁症。
先天性甲状腺功能低下症状通常是进食少、喂养困难、便秘等。
先天性甲状腺功能低是由先天性因素造成的甲状腺功能异常，大概超过95%的婴儿在出生时并没有明显的征兆。但是，部分婴儿发病后会有动作比较迟钝、容易打瞌睡的表现，需要叫醒以喂养婴儿，婴儿还可能会发出沙哑的叫声。此外，婴儿多有食欲不佳、吃得少、喂食困难、便秘、体温较低等表现，可能出现体长偏短、皮肤干燥、舌头大、脐疝、囟门大、面部浮肿等症状。
甲状腺功能低下由于原因和表现都不相同。有些患者是由于做了甲状腺手术而导致的甲减，有些患者是由于桥本氏症导致的，有些患者是由于服用了一些药物而导致的。如果出现怕冷、心动过缓、少言懒言、心情低落等症状，建议去正规的医疗机构进行检查，医生会针对其甲状腺机能下降的程度，给予适当的治疗，同时给予甲状腺激素，使其恢复到正常状态，不会对工作、学习、日常生活造成任何的干扰。
甲状腺旁腺功能低下通常会有手足、四肢抽搐、精神神经方面的表现、皮肤、头发、指甲、牙齿、眼睛、胃部、心血管、肾、骨头等。
手足痉挛的症状主要是指手足挛软，手指有麻木，有小虫爬行，有肌肉酸痛等症状。手足挛弱的症状是四肢僵硬，大拇指朝手掌里缩，其余的手指并握、伸直、僵硬等。当患者出现了精神神经症状后，可能会有癫痫样的症状。皮肤、头发、指甲、牙齿会有干性、肿胀、粗糙、毛茸茸、牙齿发育不良、软甲等。
先天性甲状腺功能低下是儿童期常见的智力障碍性疾病之一。
先天性甲状腺功能低下又称先天性甲减，又称呆小症，一般早期无明显症状，症状出现后可能已为时过晚。一旦出现症状将严重影响儿童智力发育，导致身材矮小、智力低下。若能在2个月内发现，及时治疗，可长期保持甲状腺功能正常，智力基本恢复正常。如果10个月后被发现并治疗，智商只有正常的80%左右。超过2岁后被发现的话，智力发育会下降。
