对于肾囊肿的治疗原则是持续观察，必要时需要考虑手术治疗。需要结合肾脏彩超结果及肾功能情况需要继续保守观察还是马上手术治疗，一般尽可能选择微创手术，如腹腔镜等。药物，对于囊肿是没有治疗作用的。
肾囊肿要通过药物治疗才能消除，对于小的肾脏囊肿，无症状时不需要做任何治疗，但要定期复查，观察囊肿是否继续增大。无症状者应时常进行尿液检查，包括尿常规、尿培养，每六个月至1年进行一次肾功能。
囊肿是成人肾脏最常见的一种结构异常。可为单侧或双侧。不知道单个还是多发，肾囊肿可并发尿路感染、结石、梗阻及腹膜后出血，少数有恶变的可能。如果是单纯的囊肿，没有压迫症状，一般无需治疗，半年一次复查肾脏彩超即可。如果肾囊肿直径较大，超过5厘米，可采取手术治疗。
得了肾囊肿的病人不能服用枸杞，枸杞也不能治疗肾囊肿，一般不会刺激囊肿增大，出现囊肿应到医院泌尿外科检查，依照病情采取治疗。肾囊肿病人应该养成好的生活习惯，少吃肉类，尽量避免体质酸化，控制体重，应去医院就诊。
目前，肾囊肿还没有好的特殊治疗方法。如果囊肿相对较小，囊肿的大小只能在任何时候通过观察来检查。如果囊肿相对较大，那么就需要手术。这个肾囊肿不经治疗是无法恢复的。平时，应注意饮食，控制囊肿的发展。
