亚临床甲减属于一种轻微的甲减，是指促甲状腺激素TSH的正常值，一般在5-10左右，这个时候，没有明显的甲减症状，可以不用药，而是要注意甲功的改变，三到六个月检查一次，甲功没有进一步的加重，可以不用药。
如果促甲状腺素TSH值在5-10的临床表现，包括乏力、爱困、腿肿、体重增加、多浆膜腔积液等，需要终生服用甲状腺素片，保持甲功在正常范围之内，然后每3-6个月进行一次甲功检查，并视甲功的变化而变化。
亚临床甲状腺功能减低，属于甲状腺功能异常的表现，临床表现不是很明显，对于亚临床甲减的治疗是应用药物进行补充治疗。从小剂量开始服用，注意定期复查甲状腺功能。食物中也含有碘，可以达到补充甲状腺素的效果，症状明显时终生服药。
甲状腺炎合并甲减可以通过药物进行治疗。
甲减与甲状腺炎合并甲减的区别在于，根据不同的甲状腺炎所引起的甲减，治疗的原则也是不一样的。就拿亚急性甲状腺炎来说，甲减是一种暂时性的，不需要优甲乐替代治疗，等过一段时间，甲状腺功能就会恢复正常。如果是自身免疫性甲状腺炎，那么就是终生性的甲减，终身服用优甲乐来代替治疗，主要是为了保持甲状腺功能在正常范围内，在任何情况下都不能停药。
甲减通常不导致甲状腺炎的发生，相反，自身免疫性甲状腺炎在晚期则可导致甲减。
如果发现自己有甲亢症状，就应该考虑甲减可能。对自身免疫性甲状腺炎伴甲减，治疗以外源性补充甲状腺激素代替治疗为主，使甲状腺的功能保持在正常值，目前还没有哪种方法可以使自身免疫性甲状腺炎患者体内的甲状腺自身抗体转阴，故仅能治甲减一病。如果自己的甲亢症状不严重，就不用太担心了，因为有很多人是因为甲状腺本身分泌过多的甲状腺球蛋白而导致甲减出现。
因此外源性补充甲状腺激素代替治疗，使甲功保持在正常值以内。如果出现严重的并发症则需要进行手术干预治疗。自身免疫性甲状腺炎所致甲减属于终身性甲减，就是要终身服药来代替治疗，多数甲减患者经治疗甲功恢复正常后均能像正常人那样工作、生活和学习。
甲减的治疗分为轻型病例和严重病例的治疗，早期发现的症状比较轻的情况，主要补充甲状腺素，定期复查甲状腺功能，调整药物剂量，严重病例的甲减，还需要对症治疗，如吸氧、抗感染、改善甲状腺功能减退性心脏病的症状。
